copynumberConversion(beadarraySNP)
copynumberConversion()所属R语言包：beadarraySNP
Conversion to Copynumber analysis objects
转换到Copynumber分析对象
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
SnpSetIllumina objects are converted to other objects for numerical analysis
SnpSetIllumina对象转换为其他对象的数值分析
用法----------Usage----------
convert2aCGH(object,normalizedTo=2,doLog=TRUE,organism="hsa")
convert2SegList(object,normalizedTo=2,doLog=TRUE,organism="hsa")
参数----------Arguments----------
参数：object
SnpSetIllumina object
SnpSetIllumina对象
参数：normalizedTo
numeric, 'normal' copynumber datavalue for object
数字，“正常”copynumber datavalue对象
参数：doLog
logical, perform logarithmic transformation (log2)
逻辑，进行对数变换（log2）
参数：organism
character, organism used in object. Currently 'hsa' and 'mmu' are recognized. Used to convert sex chromosomes to their proper numerical representation
性质，对象使用的有机体。目前，“HSA和MMU的认可。他们适当的数值表示用于转换性染色体
Details
详情----------Details----------
These functions produce objects that can be used by the analysis functions in the aCGH or snapCGH packages. The SnpSetIllumina intensity values are stored in a linear scale. Both types of objects assume a logarithmic scale, so by default the values are transformed to a log2 scale centered around 0.
在的aCGH或snapCGH包分析功能，可以通过使用这些功能产生的对象。 SnpSetIllumina强度值存储在一个线性比例。两种类型的对象假定对数刻度，所以默认值转化到0为中心左右的log2规模。
值----------Value----------
convert2aCGH returns a aCGH object as used in the aCGH package. convert2SegList returns a SegList object as used in the snapCGH package.
convert2aCGH返回1 aCGH对象中的aCGH包使用。 convert2SegList返回1 SegList对象作为在snapCGH包的使用。
作者（S）----------Author(s)----------
Jan Oosting
参见----------See Also----------
SnpSetIllumina-class, aCGH-class, SegList-class
SnpSetIllumina-class，aCGH-class，SegList-class
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注：
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发表于 2012-2-25 12:34:58
