BeadstudioQC(beadarraySNP)
BeadstudioQC()所属R语言包:beadarraySNP
Quality control of Beadstudio report files
Beadstudio报告文件的质量控制
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
When data has been imported using a Beadstudio samplesheet and reportfile, these functions can be used to generate quality measures
当数据已导入使用的Beadstudio samplesheet和reportfile的,这些功能可以用来生成质量的措施
用法----------Usage----------
BeadstudioQC(object, QClist = list(), arrayType = "Sentrix96")
pdfBeadstudioQC(QClist, basename = "beadstudio", by = 10)
参数----------Arguments----------
参数:object
SnpSetIllumina object.
SnpSetIllumina对象。
参数:QClist
list, result of previous call to BeadstudioQC
BeadstudioQC以前调用,结果列表
参数:arrayType
character, type of array
字符,数组类型
参数:basename
character, prefix for PDF files. This name will be added before the Barcode of the chip
字符,前缀为PDF文件。这个名字将之前加入该芯片的条码
参数:by
integer, number of samples in barplot, see reportSamplePanelQC
整数,样本数在barplot,看到reportSamplePanelQC
值----------Value----------
The BeadstudioQC function generates a list of QCIllumina objects The pdfBeadstudioQC function generates a pdf-file for each QCIllumina object in the list
BeadstudioQC函数生成的QCIllumina函数生成的PDF文件,在每个pdfBeadstudioQC对象列表QCIllumina对象名单
作者(S)----------Author(s)----------
J. Oosting
参见----------See Also----------
pdfQC,calculateQCarray
pdfQC,calculateQCarray
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注:
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