calcModfstat(attract)
calcModfstat()所属R语言包:attract
Function calculates a modified F-statistic for a set of cluster assignments.
函数计算一组聚类分配修改后的F-统计。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Function calculates a modified F-statistic for a set of cluster assignments.
函数计算一组聚类分配修改后的F-统计。
用法----------Usage----------
calcModfstat(exprs.dat, cl, class.vector)
参数----------Arguments----------
参数:exprs.dat
a matrix of gene expression values.
matrix基因的表达值。
参数:cl
a vector of cluster assignments.
vector聚类的任务。
参数:class.vector
a vector specifying group membership of the samples.
vector样品指定组的成员。
Details
详情----------Details----------
This function is called internally by findSynexprs.
这个函数内部被称为findSynexprs。
值----------Value----------
a modified F-statistic (average MSS/average RSS) value for a set of cluster assignments.
修改后的F-统计值(平均的MSS /平均RSS)一套聚类分配。
作者(S)----------Author(s)----------
Jessica Mar
举例----------Examples----------
## Not run: [#无法运行:]
library(cluster)
data(subset.loring.eset)
clustObj <- agnes(as.dist(1-t(cor(exprs(subset.loring.eset)))))
cfmod.vals <- NULL
for( i in 1:10 ){
cfmod.vals <- c(cfmod.vals, calcModfstat(exprs(subset.loring.eset), cutree(clustObj,i), pData(subset.loring.eset)$celltype))
}
k <- (1:10)[cfmod.vals==max(cfmod.vals)]
## End(Not run)[#结束(不运行)]
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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