selectSigGene(ArrayTools)
selectSigGene()所属R语言包:ArrayTools
select differentially expressed genes from the regressResult class
选择差异表达基因从regressResult类
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
select differentially expressed genes based on p value and/or fold change from the regressResult class
根据P值和/或倍从regressResult类变化,选择差异表达的基因
用法----------Usage----------
selectSigGene(object, p.value = 0.05, fc.value = 0)
参数----------Arguments----------
参数:object
an regressResult class
一个regressResult类
参数:p.value
p value
p值
参数:fc.value
fold change cut-off value
倍cut-off值
值----------Value----------
an regressResult
1 regressResult
作者(S)----------Author(s)----------
Xiwei Wu, Arthur Li
举例----------Examples----------
data(eSetExample)
design<- new("designMatrix", target=pData(eSetExample), covariates = "Treatment")
contrast<- new("contrastMatrix", design.matrix = design,
compare1 = "Treated", compare2 = "Control")
result<- regress(eSetExample, contrast)
sigResult<- selectSigGene(result, fc.value=log2(2))
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|