saving community phylogenetics datasets to a file
社区系统发育的数据集保存到一个文件中
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
write.spacodi.data generates community phylogenetic datasets to be used in the external program SPACoDi
write.spacodi.data生成社区系统发育中要使用的数据集的外部程序SPACoDi
用法----------Usage----------
write.spacodi.data(sp.plot, outfile)
参数----------Arguments----------
参数:sp.plot
a community dataset formatted for the R-package spacodiR (see as.spacodi)
社区数据集的R-spacodiR(见as.spacodi包格式)
参数:outfile
a formatted file for the Windows executable SPACoDi
一个格式化的文件的Windows可执行文件SPACoDi
Details
详细信息----------Details----------
This utility writes a species-by-plots matrix into a format readable by the external program SPACoDi, a Windows executable (available at http://ebe.ulb.ac.be/ebe/Software.html).
此实用程序编写一个物种的图矩阵外部程序可读的格式SPACoDi“一个Windows可执行(可在http://ebe.ulb.ac.be/ebe/Software.html)的。
(作者)----------Author(s)----------
Jonathan Eastman
参见----------See Also----------
as.spacodi for converting from phylocom to spacodiR formats; see spacodi.calc for community diversity measures of empirical data
as.spacodi从phylocom到spacodiR格式的转换;spacodi.calc群落多样性的措施的经验数据
实例----------Examples----------
# generate a community-phylogenetics dataset[产生一个社区系统发育的数据集]
data(sp.example)
attach(sp.example)
# save the dataset to working directory[数据集保存到工作目录]
write.spacodi.data(sp.plot=spl, outfile="spacodi.formatted.txt")