resamp.1a(spacodiR)
resamp.1a()所属R语言包:spacodiR
randomizing a community phylogenetics matrix: '1a' of Hardy (2008)
随机化社区系统发育矩阵:1哈代(2008年)
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
resamp.1a is used for resampling data within a community dataset
resamp.1a用于社区内的数据集重新采样数据
用法----------Usage----------
resamp.1a(obj, abund.class.ratio = 4)
参数----------Arguments----------
参数:obj
a community dataset in spacodiR format (see as.spacodi)
社区spacodiR格式的数据集(见as.spacodi)
参数:abund.class.ratio
a ratio defining abundance classes
丰富的类定义的比例
Details
详细信息----------Details----------
A resampling procedure for a species-by-plots matrix, where species are shuffled within abundance classes. Species are grouped into distinct abundance classes characterized by a fixed ratio: abund.class.ratio = maximal abundance / minimal abundance. For instance, if abund.class.ratio = 4, the limits between abundance classes could be 1, 4, 16, ... . Species are randomly permuted within each class, which maintains most of the abundance phylogenetic structure originally present in a dataset.
一个重采样程序,一个物种的图矩阵,其中种杂乱的丰富的类。物种组合成一个固定的比例不同的丰富的类特征:abund.class.ratio=最大丰度/最小丰度。比如,如果abund.class.ratio = 4,丰度的类之间的限制,可以是1,4,16,... 。每一个类,它维护的丰富谱系结构原本存在于一个数据集内随机置换物种。
值----------Value----------
A shuffled dataset
一个洗牌的数据集
(作者)----------Author(s)----------
Timothy Paine and Jonathan Eastman
参考文献----------References----------
structure of local communities: statistical performances of different null models and test statistics on a locally neutral community. Journal of Ecology 96:914-926.
参见----------See Also----------
spacodi.by.nodes for permutation tests of community diversity and additional randomization methods;
spacodi.by.nodes群落多样性的置换测试和额外的随机方法;
实例----------Examples----------
data(sp.example)
attach(sp.example)
spl
# shuffle dataset[洗牌的数据集]
resamp.1a(obj=spl, abund.class.ratio=3)
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