R语言 SoilR包 ThreepParallelModel()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

ThreepParallelModel(SoilR)
ThreepParallelModel()所属R语言包：SoilR

                                        Implementation of a three pool model with parallel structure
                                         三池模型实现平行结构

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function creates a model for three independent (parallel) pools. It is a wrapper for the more general function
该函数创建三个独立的（水货）池的模型。这是一个包装的更一般的功能


用法----------Usage----------


ThreepParallelModel(t, ks, C0, In, gam1, gam2, xi = 1, solver = deSolve.lsoda.wrapper)



参数----------Arguments----------

参数：t
A vector containing the points in time where the solution is sought.
一种向量，包含的点的时间寻求溶液。


参数：ks
A vector of length 3 containing the decomposition rates for the 3 pools.
一个向量的长度为3的分解速率为3个游泳池。


参数：C0
A vector of length 2 containing the initial amount of carbon for the 2 pools.
的长度为2的向量含有的碳为2池的初始量。


参数：In
A scalar or a data.frame object specifying the amount of litter inputs by time.
一个标量或数据框对象指定的凋落物输入量。


参数：gam1
A scalar representing the partitioning coefficient, i.e. the proportion from the total amount of inputs that goes to pool 1.
标量的分配系数，即从“池1的总投入量的比例。


参数：gam2
A scalar representing the partitioning coefficient, i.e. the proportion from the total amount of inputs that goes to pool 2.
标量的分配系数，即从“池2的总投入量的比例。


参数：xi
A scalar or a data.frame specifying the external (environmental and/or edaphic) effects on decomposition rates.
一个标量或数据框指定的外部（环境和/或土壤）的分解率的影响。


参数：solver
A function that solves the system of ODEs. This can be euler or ode or any other user provided function with the same interface.
的功能，解决了系统的微分方程。这可能是euler或ode或任何其他用户提供的函数具有相同的接口。


值----------Value----------

A  Model Object that can be further queried
一个模型对象，可以进一步查询


（作者）----------Author(s)----------


Carlos A. Sierra <csierra@bgc-jena.mpg.de>, Markus Mueller <mamueller@bgc-jena.mpg.de>



参见----------See Also----------

TwopParallelModel and ParallelModel
TwopParallelModel和ParallelModel


实例----------Examples----------


t_start=0
t_end=10
tn=50
timestep=(t_end-t_start)/tn
t=seq(t_start,t_end,timestep)

Ex=ThreepParallelModel(t,ks=c(k1=0.5,k2=0.2,k3=0.1),C0=c(c10=100, c20=150,c30=50),In=20,gam1=0.7,gam2=0.1,xi=0.5)
Ct=getC(Ex)

plot(t,rowSums(Ct),type="l",lwd=2,ylab="Carbon stocks (arbitrary units)",xlab="Time",ylim=c(0,sum(Ct[1,])))
lines(t,Ct[,1],col=2)
lines(t,Ct[,2],col=4)
lines(t,Ct[,3],col=3)
legend("topright",c("Total C","C in pool 1", "C in pool 2","C in pool 3"),lty=c(1,1,1,1),col=c(1,2,4,3),lwd=c(2,1,1,1),bty="n")

Rt=getReleaseFlux(Ex)
plot(t,rowSums(Rt),type="l",ylab="Carbon released (arbitrary units)",xlab="Time",lwd=2,ylim=c(0,sum(Rt[1,])))
lines(t,Rt[,1],col=2)
lines(t,Rt[,2],col=4)
lines(t,Rt[,3],col=3)
legend("topright",c("Total C release","C release from pool 1", "C release from pool 2","C release from pool 3"),lty=c(1,1,1,1),col=c(1,2,4,3),lwd=c(2,1,1,1),bty="n")

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。