R语言 soil.spec包 isric()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

isric(soil.spec)
isric()所属R语言包：soil.spec

                                        Script for publication Terhoeven-Urselmans et al. 2010.
                                         的脚本发布Terhoeven Urselmans等。 2010年。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The script for the publication: Terhoeven-Urselmans,T., Vagen,T.G., Spaargaren,O. and Shepherd,K.D. 2010. Prediction of soil fertility properties from a globally distributed soil mid-infrared spectral library. Soil Science Society of America Journal. Accepted, doi:10.2136/sssaj2009.0218.
该脚本发布：Terhoeven Urselmans，T.，沃根，TG，Spaargaren，O.和牧羊人，K.D. 2010年。从分布在全球各地的土壤中红外光谱库的土壤肥力属性的预测。美国土壤科学协会杂志。接受，DOI：10.2136/sssaj2009.0218。


用法----------Usage----------


isric(spec, chem, plo)



参数----------Arguments----------

参数：spec
a numerical matrix containing the raw spectra.
一个数值矩阵包含原始光谱。


参数：chem
a numerical data frame containing the reference values.
包含的参考值的数值数据框。


参数：plo
a data frame containing two columns. See details
包含两列的一个数据框。查看详细资料


Details

详细信息----------Details----------

The first column of plo named &ldquolot_code” contains the plot code as factor. The second column named “Depth” contains the depth-layer as factor. An example is “0 to 14” and means that this soil sample was taken from 0 to 14 cm depth.
plo的名为“Plot_code”的第一列包含因素的图代码。名为“深度”的第二列包含作为因子层的深度。一个例子是“0至14”，意味着这样的土壤样品采取从0到14厘米深。


值----------Value----------

isric returns a list with class "isric" containing the following components: <table summary="R valueblock"> <tr valign="top"><td>Table_1</td> <td> a matrix containing the summary of principal component analysis of first derivative spectra. Given as Table 1 in the publication.</td></tr> <tr valign="top"><td>Table_2_summary</td> <td> a table containing the summary of chem. Given as Table 2 in the publication.</td></tr> <tr valign="top"><td>Table_2_sd</td> <td> a numeric vector containing the standard deviation of chem. Part of Table 2 in publication</td></tr> <tr valign="top"><td>Table_3_calibration</td> <td> a matrix containing the calibration set statistics. Given as Table 3 in the publication.</td></tr> <tr valign="top"><td>Table_3_validation</td> <td> a matrix containing the validation set statistics. Given as Table 3 in the publication.</td></tr> <tr valign="top"><td>Table_4_all</td> <td> a list containing the correlation between soil property values of the whole data set. Given as upper triangle in Table 4 in the publication.</td></tr> <tr valign="top"><td>Table_4_calibration</td> <td> a list containing the correlation between soil property values of the calibration data set only. Given as lower triangle in Table 4 in the publication.</td></tr> <tr valign="top"><td>Calibration_predicted</td> <td> a data frame containing for the soil property values of the calibration set the (i) untransformed values, (ii) box-cox transformed values, (iii) predicted box-cox transformed values and (iv) back-transformed predicted values.</td></tr> <tr valign="top"><td>Validation_predicted</td> <td> a data frame containing for the soil property values of the validation set the (i) untransformed values, (ii) box-cox transformed values, (iii) predicted box-cox transformed values and (iv) back-transformed predicted values.</td></tr> </table>
isric返回一个列表类"isric"包含以下组件：<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"> <TD> Table_1</ TD> < TD>矩阵的一阶导数光谱主成分分析的总结。如表1给出在出版物中。</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD> Table_2_summary</ TD> <td>一个表包含chem摘要 。在出版物如表2所示。</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD>Table_2_sd </ TD> <td>一个数字向量的标准偏差<X >。部分表2中出版</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD>chem</ TD> <td>一个矩阵校正集统计。如表3中给出的出版。</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD>Table_3_calibration</ TD> <TD>矩阵中的验证组的统计信息。在出版物如表3。</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD>Table_3_validation </ TD> <td>一个列表，其中包含的土壤属性值之间的相关性整个数据集。由于在出版物上三角表4。</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD>Table_4_all </ TD> <td>一个列表，其中包含土壤性质之间的相关性的校准数据的值只设置。由于在表4中公布的下三角。</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD> Table_4_calibration </ TD> <td>一个数据框包含的土壤属性值的校准设置（一）未转换的值，（二）的Box-Cox转换后的值，（三）预测的Box-Cox转换值及（iv）反向变换的预测值。</ TD> </ TR> <TR VALIGN =“顶”> <TD>Calibration_predicted </ TD> <TD>一个数据框包含的土壤属性值的验证设置（一）未转换的值，（二）的Box-Cox转换后的值， （三）预测的Box-Cox转换值及（iv）反向变换的预测值。</ TD> </ TR> </ TABLE>


（作者）----------Author(s)----------


Thomas Terhoeven-Urselmans

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