找回密码
 注册
查看: 737|回复: 0

R语言 arrayQuality包 qualBoxplot()函数中文帮助文档(中英文对照)

[复制链接]
发表于 2012-2-25 12:11:40 | 显示全部楼层 |阅读模式
qualBoxplot(arrayQuality)
qualBoxplot()所属R语言包:arrayQuality

                                        Comparative boxplot for general hybridization Quality Control
                                         一般杂交质量控制比较盒形图

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This functions allows you to graphically compare your slide quality measures to results obtained for a database of 'good quality'
此功能允许您以图形方式比较您的幻灯片质量的措施,为“品质优良”数据库中获得的结果


用法----------Usage----------


qualBoxplot(arrayQuality = NULL, reference = NULL, organism = c("Mm", "Hs"), DEBUG=FALSE,...)



参数----------Arguments----------

参数:arrayQuality
Matrix of quality results from slideQuality or globalQuality.
矩阵slideQuality或globalQuality质量的结果。


参数:reference
A matrix resulting from globalQuality, to be used as reference table to compare slides. If 'NULL', the default table corresponding to "organism" will be used. See details for more information.
矩阵从globalQuality的,作为参考表用来比较的幻灯片。如果“NULL”,默认表中相应的“有机体”将被使用。详情请参阅更多信息。


参数:organism
A "character" string naming the organism genome printed on the array, either "Mm" or "Hs". By default, organism is set to "Mm". It is used to retrieve the corresponding reference tables.
一个“字符”字符串命名的生物体的基因组阵列上,无论是“MM”或“HS”。默认情况下,机体被设置为“MM”。它是用来检索相应的参考表。


参数:DEBUG
If 'TRUE', debug statements are printed.
如果“TRUE”,打印调试语句。


参数:...
additional arguments
额外的参数


Details

详情----------Details----------

You can use your own set of references created using globalQuality passed in the arguments "reference", or use
您可以使用您的参考使用globalQuality通过在“参考”的论点,或者使用创建自己的一套


值----------Value----------

Returns a score vector containing, for each column in "arrayQuality", the number of quality measures below the range of "reference". The last element of the score vector is the total number of quality measures tested.
比分返回一个向量,每列在“arrayQuality”的,下方的“引用”的范围的质量措施。得分向量的最后一个元素是总数的质量检验措施。


作者(S)----------Author(s)----------


Agnes Paquet



参见----------See Also----------

globalQuality, gpQuality,
globalQuality,gpQuality


举例----------Examples----------


datadir <- system.file("gprQCData", package="arrayQuality")
if(interactive())
{
gprData <- readGPR(fnames="9Mm137.gpr", path=datadir)
arrayQuality <- slideQuality(gprData, organism="Mm")
qualBoxplot(arrayQuality)}

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
回复

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则

手机版|小黑屋|生物统计家园 网站价格

GMT+8, 2025-1-24 01:20 , Processed in 0.023877 second(s), 16 queries .

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2024 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表