snpgdsSampMissrate(SNPRelate)
snpgdsSampMissrate()所属R语言包:SNPRelate
Missing Rate of Samples
样品漏检率
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Return the missing fraction for each sample
返回缺少的部分对每个样品
用法----------Usage----------
snpgdsSampMissrate(gdsobj, sample.id = NULL, snp.id = NULL)
参数----------Arguments----------
参数:gdsobj
the gdsclass object in the gdsfmt package
gdsclass对象在gdsfmt包
参数:sample.id
a vector of sample id specifying selected samples; if NULL, all samples are used
一个向量的样品ID指定选取的样本,如果为NULL,所有样本都
参数:snp.id
a vector of snp id specifying selected SNPs; if NULL, all SNPs are used
一个向量指定选定的单核苷酸多态性SNP ID,如果为NULL,所有的SNP
值----------Value----------
a vector of numeric values
一个向量的数值
(作者)----------Author(s)----------
Xiuwen Zheng <a href="mailto:zhengx@u.washington.edu">zhengx@u.washington.edu</a>
参见----------See Also----------
snpgdsSNPRateFreq
snpgdsSNPRateFreq
实例----------Examples----------
# open an example dataset (HapMap)[打开示例数据集(人类基因组单体型图)]
genofile <- openfn.gds(snpgdsExampleFileName())
RV <- snpgdsSampMissrate(genofile)
summary(RV)
# close the genotype file[关闭基因型文件]
closefn.gds(genofile)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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