plotMissing(SNPassoc)
plotMissing()所属R语言包:SNPassoc
Plot of missing genotypes
图缺失基因型
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Plot a grid showing which genotypes are missing
绘制一个网格显示缺少的基因型
用法----------Usage----------
plotMissing(x, print.labels.SNPs = TRUE,
main = "Genotype missing data", ...)
参数----------Arguments----------
参数:x
an object of class 'setupSNP'
对象类的setupSNP“
参数:print.labels.SNPs
should labels of SNPs be printed?
标签SNP位点进行打印呢?
参数:main
title to place on plot
标题放在图
参数:...
extra arguments of 'image' function
额外的参数的“形象”功能
Details
详细信息----------Details----------
This function uses 'image' function to plot a grid with black pixels where the genotypes are missing.
此功能使用“图像”功能绘制一个网格,黑色像素的基因型丢失。
值----------Value----------
None
无
参见----------See Also----------
setupSNP
setupSNP
实例----------Examples----------
data(SNPs)
data(SNPs.info.pos)
ans<-setupSNP(SNPs,colSNPs=6:40,sep="")
plotMissing(ans)
# The same plot with the SNPs sorted by genomic position and [相同的图与单核苷酸多态性的基因组位置排序和]
# showing the information about chromosomes[染色体的信息]
ans<-setupSNP(SNPs,colSNPs=6:40,sort=TRUE,SNPs.info.pos,sep="")
plotMissing(ans)
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