odds(SNPassoc)
odds()所属R语言包:SNPassoc
Extract odds ratios, 95% CI and pvalues
提取比值比(OR),95%CI pvalues的
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Extract odds ratios, 95
解压缩后的比值比,95
用法----------Usage----------
odds(x, model=c("log-additive", "dominant", "recessive", "overdominant", "codominant"), sorted=c("no","p-value","or"))
参数----------Arguments----------
参数:x
an object of class 'WGassociation' output of WGassociation
对象的类的WGassociation“的WGassociation输出
参数:model
model to be extracted. Only first one is used. The first letter is enough, low or upper case.
要被提取的模型。仅使用第一个。的第一个字母是不够的,低或大写。
参数:sorted
Sort the output by P value or OR.
P值或OR排序输出。
值----------Value----------
A matrix with OR 95% CI (lower, upper) and P value for the selected model. For codominant model, the OR and 95%CI are given for heterozygous and homozigous.
一个矩阵,OR 95%CI(下,上)和P值的选择模型。的OR和95%CI为显性模型,给出杂合子和homozigous。
参考文献----------References----------
JR Gonzalez, L Armengol, X Sole, E Guino, JM Mercader, X Estivill, V Moreno. SNPassoc: an R package to perform whole genome association studies. Bioinformatics, 2007;23(5):654-5.
实例----------Examples----------
data(SNPs)
datSNP<-setupSNP(SNPs,6:40,sep="")
ans<-WGassociation(casco~1,data=datSNP,model="all")
odds(ans)
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|