R语言 SMCP包 SMCP()函数中文帮助文档(中英文对照)

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SMCP(SMCP)
SMCP()所属R语言包：SMCP

                                        Smoothed minimax concave penalization (SMCP) method for genome-wide association studies.
                                         平滑极大极小：凹处罚（SMCP）全基因组关联研究的方法。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Fit coefficients paths for a linear model with smoothed minimax concave penalty (SMCP). The model is marginalized so that missing values can be accommendated.
拟合系数的线性模型与平滑的的极大极小凹处罚（SMCP）的路径。该模型被边缘化的，可以accommendated遗漏值的。


用法----------Usage----------


SMCP(x,y,alpha,lambda,gamma,eps=1e-20,n.iter=100)
sp(x,y,alpha,n.lambda,lambda.min=ifelse(n>p,.001,.05),gamma)



参数----------Arguments----------

参数：x
The design matrix which can include missing values.
设计矩阵，其中包括遗漏值。


参数：y
The response variable.
响应变量。


参数：alpha
The proportion of the tuning parameter for MCP and QA parts. alpha*lambda is the tuning parameter for MCP. (1-alpha)*lambda is the tuning parameter for QA part.
的调谐参数为MCP和QA份的比例。 α* lambda是MCP的调整参数。 （1-α）*λQA部分的调整参数。


参数：lambda
The overall tuning parameter.
整体调整参数。


参数：gamma
The MCP tuning parameter which affects the magnitude of the shrinkage.
MCP调谐参数从而影响收缩的幅度。


参数：eps
Covergence criterion. The iteration will stop if the relative change is smaller than eps
敛散性的标准。将停止迭代的相对变化小于EPS


参数：n.iter
The maximum number of iterations
迭代的最大数量


参数：n.lambda
The number of lambdas to be solved for the solution paths
要解决的的溶液路径的数目lambda表达式


参数：lambda.min
The minimum lambda to find solution paths
最低lambda来找到解决路径


Details

详细信息----------Details----------

The function minimizes 1/(2n)MLS+SMCP, where MLS is the marginalized least squares, SMCP is a smoothed minimax concave penalty.
的功能，最大限度地减少1 /（2n）的MLS + SMCP，MLS是被边缘化的最小二乘，，SMCP是一个平滑的极大极小凹处罚。


值----------Value----------

An object with S3 class '"SMCP"' containing: beta: The fitted values of coefficients.  w2 : The weights for QA parts computed as adjacent correlation.
S3类“SMCP”载：β系数的拟合值的对象。 W2：QA部分的权重计算相邻相关。

An object with S3 class '"sp"' containing: sp : The solution paths for the lambda from the maximum to the minimum. The number of columns equals the number of coefficients, and the number of rows is equal to 'n.lambda'. The first row is the coefficients for the maximum lambda, and the last row is for the minimum lambda.
一个对象，S3类的“SP”载：SP：该解决方案的lambda从最大到最小的路径。的列数等于的系数的数量，和的行数等于n.lambda。第一行是系数为最大的lambda，和为最小的lambda的最后一行。


（作者）----------Author(s)----------


Jin Liu <jin-liu@uiowa.edu>



参考文献----------References----------

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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