R语言 aroma.light包 fitNaiveGenotypes.numeric()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

fitNaiveGenotypes.numeric(aroma.light)
fitNaiveGenotypes.numeric()所属R语言包：aroma.light

                                        Fit naive genotype model from a normal sample
                                         适合幼稚型模式，从一个正常的样本

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Fit naive genotype model from a normal sample.
适合幼稚型模式，从一个正常的样本。


用法----------Usage----------





参数----------Arguments----------

参数：y
A numeric vector of length J containing allele B fractions for a normal sample.
一个numericvector长度为j的正常样本的等位基因B组分。


参数：cn
An optional numeric vector of length J specifying the true total copy number in \{0,1,2,NA\} at each locus.  This can be used to specify which loci are diploid and which are not, e.g. autosomal and sex chromosome copy numbers.
一个可选的numericvector长度为j的指定\{0,1,2,NA\}在每个座位的真实总套数的。这可以用来指定位点是二倍体，哪些不是，如常染色体和性染色体拷贝数。


参数：subsetToFit
An optional integer or logical vector specifying which loci should be used for estimating the model. If NULL, all loci are used.
可选integer或logicalvector指定位点应估算模型使用。如果NULL，所有的位点。


参数：flavor
A character string specifying the type of algorithm used.
一个character字符串，指定使用的算法类型。


参数：adjust
A postive double specifying the amount smoothing for the empirical density estimator.
一个阳性的double指定平滑的经验密度估计的金额。


参数：...
Additional arguments passed to findPeaksAndValleys().
额外的参数传递findPeaksAndValleys（）的。


参数：censorAt
A double vector of length two specifying the range for which values are considered finite.  Values below (above) this range are treated as -Inf (+Inf).
一个doublevector长度指定为值被认为是有限的范围内。下面（上面）这个范围的值被视为 - Inf（Inf）。


参数：verbose
A logical or a Verbose object.
一个logical或Verbose对象。


值----------Value----------

Returns a list of lists.
返回一个listSlist。


作者（S）----------Author(s)----------


Henrik Bengtsson (<a href="http://www.braju.com/R/">http://www.braju.com/R/</a>)



参见----------See Also----------

To call genotypes see *callNaiveGenotypes(). Internally findPeaksAndValleys() is used to identify the thresholds.
要调用基因型看到*callNaiveGenotypes()。国内findPeaksAndValleys（）是用来确定阈值。

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。