R语言 apComplex包 TAP()函数中文帮助文档(中英文对照)

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TAP(apComplex)
TAP()所属R语言包：apComplex

                                        Tandem Affinity Purification (TAP) Data from Gavin et al. (2002)
                                         串联亲和纯化（TAP），加文等人的数据。 （2002年）

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

TAP data published by Gavin, et al. (2002).
点选公布的数据由Gavin，等。 （2002年）。


用法----------Usage----------


data(TAP)
data(TAPgraph)



Details

详情----------Details----------

TAP is a matrix of the TAP data published by Gavin, et al. (2002).  The 455 rows correspond to bait proteins and the 1364 columns correspond to proteins found as hits in the TAP experiment and are named accordingly. The first 455 column names are the same as the 455 row names; bait proteins can also be found as hits by other baits, hence their inclusion as columns in TAP.  An entry of "1" in the ith row and jth column of TAP indicates that bait protein i found protein j as a hit.  All other entries are "0".  There are a total of 3420 "1" entries in the matrix, corresponding to the 3420 comemberships detected in the experiment.
TAP是由Gavin，等公布的TAP数据的矩阵。 （2002年）。 455行对应诱饵蛋白和1364列对应为命中的TAP实验中发现的蛋白质，并命名为相应。第一个455列名455行名称相同;作为诱饵蛋白也可以点击其他诱饵，因此其作为列入TAP列。 TAP在第i行第j列的“1”的条目，我发现蛋白作为一击j表明，诱饵蛋白。所有其他项目均为“0”。有3420“1”条目中的矩阵，相应的检测实验中的3420 comemberships。

TAPgraph is a graphNEL object in which 1364 nodes represent proteins and 3420 directed edges represent comemberships detected in the purification.  Each directed edge originates at the bait and ends at the hit.  Each edge in TAPgraph corresponds to an entry of "1" in the TAP matrix.
TAPgraph是graphNEL对象，其中1364节点代表蛋白质和3420有向边代表在净化检测comemberships。每个导演的边缘，起源于诱饵和命中结束。每个TAPgraph边缘对应进入TAP矩阵中“1”。

These data are available in Supplementary Table S1 of Gavin et al. at http://www.nature.com.
这些数据是在加文等人的补充表S1。在http://www.nature.com。


源----------Source----------

Gavin, et al.  Functional organization of the yeast proteome by systematic analysis of protein complexes.  Nature 415, 141-147 (2002).
加文，等。蛋白质复合物的系统分析酵母蛋白质的功能组织。自然保护区415，141-147（2002）。


参考文献----------References----------

interaction data.  Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology 3, Article 39 (2004).
networks.  Bioinformatics 21, 3548-3557 (2005).

参见----------See Also----------

yTAP,MBMEcTAP,SBMHcTAP,UnRBBcTAP,HMSPCI
yTAP，MBMEcTAP，SBMHcTAP，UnRBBcTAP，HMSPCI


举例----------Examples----------


data(TAP)
which(TAP["Abd1",]==1)

data(TAPgraph)
adj(TAPgraph,"Abd1")

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