R语言 apComplex包 TAP complexes()函数中文帮助文档(中英文对照)

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TAP complexes(apComplex)
TAP complexes()所属R语言包：apComplex

                                        TAP data complex estimates
                                         挖掘数据复杂的估计

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Affiliation matrices with rows corresponding to proteins and columns corresponding to complexes.
行相应的蛋白质和列对应的复合物的隶属矩阵。


用法----------Usage----------


data(MBMEcTAP)
data(SBMHcTAP)
data(UnRBBcTAP)



Details

详情----------Details----------

These are the results from an analysis of the TAP data (Gavin et al., 2002) by Scholtens and Gentleman (2004) and Scholtens, Vidal, and Gentleman (submitted). These estimates were constructed using findComplexes with a sensitivity  parameter of .75, specificity of .995, and Beta=-0.2 for externally derived similarity measure based on Gene Ontology cellular component annotation (see Scholtens and Gentleman (2004)).
这些都是从数据Scholtens和绅士（2004）和Scholtens，维达尔和绅士（提交）的TAP（加文等，2002）的分析结果。这些估计使用findComplexes.75，.995特异性，和β= -0.2敏感性参数与外部派生的相似基因本体论的单元成分的注解（请参阅Scholtens和绅士（2004））为基础的措施。

MBMEcTAP contains 260 multi-bait-multi-edge complex estimates. SBMHcTAP contains 325 single-bait-multi-hit complex estimates. UnRBBcTAP contains 123 unreciprocated bait-bait complex estimates.  These data are also available at http://www.bioconductor.org/Docs/Papers/2003/apComplex.
MBMEcTAP包含260多饵多边缘的复杂估计。 SBMHcTAP包含325单诱饵多打复杂的估计。 UnRBBcTAP包含123 unreciprocated的诱饵诱饵复杂的估计。这些数据也可在http://www.bioconductor.org/Docs/Papers/2003/apComplex。


源----------Source----------

Scholtens D and Gentleman R.  Making sense of high-throughput protein-protein interaction data.  Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology 3, Article 39 (2004).
scholtens D和绅士河高通量蛋白质相互作用数据的意义。统计中的应用遗传学和分子生物学3，第39条（2004年）。

Scholtens D, Vidal M, and Gentleman R.  Local modeling of global interactome networks.  Bioinformatics 21, 3548-3557 (2005).
scholtensð，维达尔男，绅士R.全球相互作用组网络的局部造型。生物信息学21，3548-3557（2005）。


参考文献----------References----------

systematic analysis of protein complexes.  Nature 415, 141-147 (2002).

参见----------See Also----------

TAP, TAPgraph,
TAP，TAPgraph


举例----------Examples----------


data(MBMEcTAP)
MBMEcTAP[1:10,1:3]
which(MBMEcTAP[,"MBME1"]==1)



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