kroganBPMat2006(apComplex)
kroganBPMat2006()所属R语言包:apComplex
Tandem Affinity Purification (TAP) Data from Krogan et al. (2006)
串联亲和纯化(TAP),Krogan等数据。 (2006年)
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
TAP data published by Krogan, et al. (2006).
点选Krogan,等公布的数据。 (2006年)。
用法----------Usage----------
data(kroganBPMat2006)
Details
详情----------Details----------
kroganBPMat2006 is a matrix of the TAP data published by Krogan, et al. (2006). The 2264 rows correspond to bait proteins and the 5361 columns correspond to proteins found as hits in the TAP experiment and are named accordingly. The first 2264 column names are the same as the 2264 row names; bait proteins can also be found as hits by other baits, hence their inclusion as columns in kroganBPMat2006. An entry of "1" in the ith row and jth column of kroganBPMat2006 indicates that bait protein i found protein j as a hit. All other entries are "0". There are a total of "1" entries in the matrix, corresponding to the 63360 comemberships detected in the experiment.
kroganBPMat2006是Krogan,等公布的TAP数据的矩阵。 (2006年)。 2264行对应诱饵蛋白和5361列对应为命中的TAP实验中发现的蛋白质,并命名为相应。第一2264列名作为2264行名称相同;作为诱饵蛋白也可以点击其他诱饵,因此其作为列入kroganBPMat2006列。 kroganBPMat2006在第i行第j列的“1”的条目,我发现蛋白作为一击j表明,诱饵蛋白。所有其他项目均为“0”。有一个“1”条目中的矩阵,相应的在实验中检测到了63360 comemberships。
These data were obtained from the Primary Source -
获得这些数据的主要来源 -
源----------Source----------
N Krogan et al. Global Landscape of Protein Complexes in the Yeast, S. Cerevisiae. Nature, 440:667-643, 2006.
列印Krogan等。全球景观在酵母蛋白复合物,酿酒酵母。自然,440:667-643,2006。
参见----------See Also----------
yTAP,MBMEcTAP,SBMHcTAP,UnRBBcTAP,HMSPCI
yTAP,MBMEcTAP,SBMHcTAP,UnRBBcTAP,HMSPCI
举例----------Examples----------
data(kroganBPMat2006)
which(kroganBPMat2006[1,]==1)
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