R语言 SKAT包 Resampling_FWER()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

Resampling_FWER(SKAT)
Resampling_FWER()所属R语言包：SKAT

                                        Return significant SNP sets after controlling family wise error rate (FWER)
                                         返回显着的SNP组在控制家庭明智的误码率（FWER后）

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function returns significant SNP sets after controlling for family wise error rate (FWER)  using resampled residuals. To use it, you need to obtain resampling residuals using SKAT_Null_Model,  and then conduct the SKAT repeatedly for all genes/SNP sets or use SKAT.SSD.All function.
这个函数返回了显着的SNP组在控制家庭明智的误码率（FWER）的重采样残差。要使用它，你需要使用SKAT_Null_Model获得重采样的残差，然后进行SKAT反复用于所有基因/ SNP套，或使用SKAT.SSD.All功能。


用法----------Usage----------



        Resampling_FWER(obj,FWER=0.05)

        Resampling_FWER_1(P.value, P.value.Resampling, FWER=0.05)




参数----------Arguments----------

参数：obj
an object returned from SKAT.SSD.All function.
返回的对象SKAT.SSD.All功能。


参数：P.value
a vector of the SKAT p-value. If you test 100 genes, this vector should have 100 p-values.
的SKAT p-值的矢量。如果你测试了100个基因，这个向量应该有100 p值。


参数：P.value.Resampling
a matrix of p-values of the resampled residuals. Each row represents each gene/snp set, and each column represents resampling set. For example, if you have 100 genes, and conducted resampling 1000 times ( ex.n.Resampling=1000 in SKAT_Null_Model), then it should be a 100 x 1000 matrix.   
的矩阵的p-值的经重新采样的残差。每一行代表每一个基因/ SNP一套的，每一列代表重新取样设置。例如，如果你有100个基因，并进行了，重采样1000次（ex.n.Resampling = 1000 SKAT_Null_Model），那么它应该是一个100×1000矩阵。


参数：FWER
a numeric value of FWER rate to control (default=0.05)
一个数值控制FWER率（默认= 0.05）


值----------Value----------


参数：results
If you use the returned object from SKAT.SSD.all function,  it is a sub-table of significant snp sets of the result table in the obj.  If you use P.value and P.value.Resampling, it is a vector of significant p-values.  If there is no significant snp set, it has NULL value.  
如果您使用返回的对象从SKAT.SSD.all功能，这是一个重要的SNP组的结果表中的obj的子表。如果您使用P.value的和P.value.Resampling，这是一个显着的P-值向量。如果没有显着的SNP集，它具有NULL值。


参数：n
a numeric value of the number of significant snp sets.
一个数字的值的数目显着的SNP集。


参数：ID
a vector of indexes of significant snp sets.
一个显着的SNP组的索引向量。


（作者）----------Author(s)----------


Seunggeun Lee

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。