R语言 SimHap包 summary.snpSurv()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

summary.snpSurv(SimHap)
summary.snpSurv()所属R语言包：SimHap

                                        Summarizing Single SNP analysis models for survival data
                                         单核苷酸多态性分析模型的生存数据综述

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Summary method for objects of class snpSurv
摘要方法的类的对象的snpSurv


用法----------Usage----------


## S3 method for class 'snpSurv'
summary(object, ...)
## S3 method for class 'summary.snpSurv'
print(x, digits = max(3, getOption("digits") - 3),
        signif.stars = getOption("show.signif.stars"), ...)



参数----------Arguments----------

参数：object
an object of class snpSurv
一个对象的类snpSurv


参数：x
an object of class summary.snpSurv, the result of a call to  <PRE>summary.snpSurv.</PRE>
一个对象的类summary.snpSurv，一个调用到<PRE> summary.snpSurv的结果。</ PRE>


参数：digits
the number of significant digits to use when printing.
打印时所使用的数量显著数字。


参数：signif.stars
logical. If TRUE, &ldquo;significance stars" are printed for each coefficient.
逻辑。如果TRUE，“意义明星”打印每个系数。


参数：...
further arguments passed to or from other methods.
进一步的参数传递给其他方法。


值----------Value----------

summary.snpSurv returns an object of class summary.snpSurv, a list with components
summary.snpSurv返回一个对象，组件类summary.snpSurv“的列表


参数：terms
terms attribute of formula1 called in snp.surv.
条款属性的公式叫snp.surv。


参数：coefficients
summarized results from fitted model, including hazard ratios and p-values.
汇总结果拟合模型，包括风险比和p-值。


参数：formula
formula1 used in snp.surv.
formula1在snp.surv使用。


参数：LRT
likelihood ratio test comparing the model with SNP variables compared to the model without SNPs.
似然比检验比较模型相比，模型，而不单核苷酸多态性SNP变量。


参数：Wald
Wald statistic for the fitted model.
Wald统计量的拟合模型。


参数：rsquared
adjusted r-squared values for the fitted model.
调整后的R平方值的拟合模型。


参数：residuals
the residuals, that is response minus fitted values.
残差，，是响应减去拟合值。


（作者）----------Author(s)----------


Pamela A. McCaskie



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

snp.surv
snp.surv


实例----------Examples----------



data(SNPsurv.dat)

# transforms SNPlong.dat to an object containing 3 columns[转换到一个对象，它包含3列的SNPlong.dat]
# per SNP - additive, dominant and recessive, where genotypes[每个SNP  - 添加剂，显性和隐性的，其中基因型]
# defined in 'baseline' serve as the baseline genotypes[中定义的“基线”作为基线基因型]
survGeno.dat <- SNP2Geno(SNPsurv.dat, baseline=c("V2V2", "GG", "CC"))

data(survPheno.dat)
mymodel <- snp.surv(formula1=Surv(time, status)~age+SNP_1_add,
        formula2=Surv(time, status)~age, pheno=survPheno.dat,
        geno=survGeno.dat)
summary(mymodel)


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。