R语言 SimHap包 summary.hapLong()函数中文帮助文档(中英文对照)

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summary.hapLong(SimHap)
summary.hapLong()所属R语言包：SimHap

                                        Summarizing single SNP analysis models for longitudinal data
                                         单个SNP分析纵向数据模型综述

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Summary method for objects of class snpLong
摘要方法的类的对象的snpLong


用法----------Usage----------


## S3 method for class 'hapLong'
summary(object, ...)
## S3 method for class 'summary.hapLong'
print(x, digits = max(3, getOption("digits") - 3),
        signif.stars = getOption("show.signif.stars"), ...)




参数----------Arguments----------

参数：object
an object of class hapLong, a result of a call to haplo.long.
类的一个对象hapLong，其结果，调用haplo.long。


参数：x
an object of class summary.hapLong, the result of a call to  <PRE>summary.hapLong.</PRE>
类的一个对象summary.hapLong，结果的调用<PRE> summary.hapLong。</ PRE>


参数：digits
the number of significant digits to use when printing.
打印时所使用的数量显著数字。


参数：signif.stars
logical. If TRUE, &ldquo;significance stars" are printed for each coefficient.
逻辑。如果TRUE，“意义明星”打印每个系数。


参数：...
further arguments passed to or from other methods.
进一步的参数传递给其他方法。


值----------Value----------

summary.hapLong returns an object of class summary.hapLong. A list with components
summary.hapLong返回一个类summary.hapLong对象。组件列表


参数：fixed_formula
fixed effects formula used in haplo.long.
固定效应在haplo.long公式中使用。


参数：random_formula
random effects formula used in haplo.long.
随机效应在haplo.long公式中使用。


参数：coefficients
summarized results from fitted model, including coefficients, standard errors and p-values.
汇总结果拟合模型，包括系数，标准差和p值。


参数：empiricalResults
a list containing the coefficients, standard errors and p-values calculated at each simulation of haplo.long.
一个列表，其中包含的系数，标准差和p-值计算在每个模拟haplo.long。


参数：AIC
Akaike Information Criterion for the model fitted in haplo.long.
赤池信息准则的模型安装在haplo.long。


参数：corStruct
the correlation structure specified in haplo.long.
在haplo.long指定的相关结构。


参数：effect
the haplotypic effect modelled: "ADDITIVE", "DOMINANT" or "RECESSIVE".
单倍型效应建模：“添加剂”，“显性”或“隐性”。


（作者）----------Author(s)----------


Pamela A. McCaskie



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

haplo.long
haplo.long


实例----------Examples----------



data(SNPlong.dat)

# convert SNP.dat to format required by infer.haplos[SNP.dat转换，格式化所需的infer.haplos]
longHaplo.dat <- SNP2Haplo(SNPlong.dat)

data(longPheno.dat)

myinfer<-infer.haplos(longHaplo.dat)
myinfer$hap.freq

myhaplo<-make.haplo.rare(myinfer,min.freq=0.05)
mymodel <- haplo.long(fixed=fev1f~h.ACV2, random=~1|ID,
        pheno=longPheno.dat, haplo=myhaplo, cor="corCAR1", form=~year|ID, sim=10)
summary(mymodel)



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