epi.quant(SimHap)
epi.quant()所属R语言包:SimHap
Epidemiological analysis for quantitative outcomes
定量结果的流行病学分析
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
epi.quant is used to fit linear regression models to single SNP genotype and phenotype data for a continuous Normal outcome.
epi.quant线性回归模型来拟合单个SNP的基因型和表型数据的连续正常结果。
用法----------Usage----------
epi.quant(formula, pheno, sub = NULL)
参数----------Arguments----------
参数:formula
a symbolic description of the full model to be fit. The details of model specification are given below.
一个象征性的描述,完整的模型是合适的。模型规范的细节在下面给出。
参数:pheno
a dataframe containing phenotype data.
一个数据框的表型数据。
参数:sub
an expression representing a subset of the data on which to perform the models.
的数据的一个子集的表达式,表示在其上执行的模型。
Details
详细信息----------Details----------
formula should be in the form of response ~ predictor(s). A formula has an implied intercept term. See documentation for formula function for more details of allowed formulae.
formula应该是的形式response ~ predictor(s)。公式有一个隐含的截距项。 formula功能允许的公式的详细信息,请参阅文档。
值----------Value----------
epi.quant returns an object of class epiQuant containing the following items
epi.quant返回一个对象类epiQuant包含以下项目
参数:formula
formula passed to epi.quant.
公式传递到epi.quant。
参数:results
a table containing the coefficients, standard errors and p-values of the parameter estimates.
一个表中包含的系数,标准误差及p-值的参数估计。
参数:fit.lm
a lm object fit using formula.
lm对象适合使用公式。
参数:ANOD
analysis of deviance table for the model fit using formula.
分析偏差表的模型拟合公式。
参数:logLik
the log-likelihood for the linear model fit using formula.
对数似然的线性模型拟合公式。
参数:AIC
Akaike Information Criterion for the linear model fit using formula.
赤池信息准则的线性模型拟合公式。
(作者)----------Author(s)----------
Pamela A. McCaskie
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
snp.quant, haplo.quant, epi.bin
snp.quant,haplo.quant,epi.bin
实例----------Examples----------
data(pheno.dat)
mymodel <- epi.quant(formula=LDL~AGE+SBP, pheno=pheno.dat)
summary(mymodel)
# example with a subsetting variable, looking at males only[例如,一个子集变量,只在男性]
mymodel <- epi.quant(formula=LDL~AGE+SBP, pheno=pheno.dat,
sub=expression(SEX==1))
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