getProbeData_1lq(AnnotationDbi)
getProbeData_1lq()所属R语言包:AnnotationDbi
Read a 1lq file for an Affymetrix genechip
读了一个Affymetrix基因1lq文件
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Read a 1lq file for an Affymetrix genechip
读了一个Affymetrix基因1lq文件
用法----------Usage----------
getProbeData_1lq(arraytype, datafile, pkgname = NULL)
参数----------Arguments----------
参数:arraytype
Character. Array type (e.g. 'Scerevisiaetiling)
字符。数组类型(例如“Scerevisiaetiling)
参数:datafile
Character. The filename of the input data file. If omitted a default name is constructed from arraytype (see this function's source code).
字符。输入数据文件的文件名。如果省略,默认的名字是arraytype(看到这个函数的源代码)。
参数:pkgname
Character. Package name. If NULL the name is derived from arraytype.
字符。包的名称。如果为NULL的名字来源于从arraytype。
Details
详情----------Details----------
This function serves as an interface between the (1) representation of array probe information data in the packages that are generated by makeProbePackage and (2) the vendor- and possibly version-specific way the data are represented in datafile.
此功能提供<X阵探针信息数据(1)表示在makeProbePackage(2)供应商和版本特定的方式表示数据在生成的包之间的接口>
值----------Value----------
A list with three components
三个组成部分的列表
参数:dataEnv
an environment which contains the data frame with the probe sequences and the other probe data.
环境,其中包含了与探针序列和其他探测数据的数据框。
参数:symVal
a named list of symbol value substitutions which can be used to customize the man pages. See createPackage.
命名的符号价值,可用于定制的手册页换人名单。看到createPackage。
参数:pkgname
a character with the package name; will be the same as the function parameter pkgname if it was specified; otherwise, the name is constructed from the parameter arraytype.
一个包的名称字符;将作为函数的参数pkgname如果它被指定相同的,否则,这个名字是从参数arraytype兴建。
参见----------See Also----------
makeProbePackage
makeProbePackage
举例----------Examples----------
## makeProbePackage([#makeProbePackage(]
## arraytype = "Scerevisiaetiling",[#arrayType的=“Scerevisiaetiling”]
## maintainer= "Wolfgang Huber <huber@ebi.ac.uk>",[#维护者=“沃尔夫冈·胡伯<huber@ebi.ac.uk>”]
## version = "1.1.0",[#版本=“1.1.0”]
## datafile = "S.cerevisiae_tiling.1lq",[#数据文件=“S.cerevisiae_tiling.1lq”]
## importfun = "getProbeData_1lq")[#importfun“getProbeData_1lq”)]
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