R语言 AnnotationDbi包 getProbeDataAffy()函数中文帮助文档(中英文对照)

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getProbeDataAffy(AnnotationDbi)
getProbeDataAffy()所属R语言包：AnnotationDbi

                                        Read a data file describing the probe sequences on an Affymetrix genechip
                                         读取数据文件描述的Affymetrix基因芯片的探针序列

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Read a data file describing the probe sequences on an Affymetrix genechip
读取数据文件描述的Affymetrix基因芯片的探针序列


用法----------Usage----------


getProbeDataAffy(arraytype, datafile, pkgname = NULL, comparewithcdf = TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：arraytype
Character. Array type (e.g. 'HG-U133A')
字符。数组类型（如HG-U133A）


参数：datafile
Character with the filename of the input data file, or a connection (see example). If omitted a default name is constructed from arraytype (for details you will need to consult this function's source code).
字符与输入数据文件的文件名，或连接（见例子）。如果省略，默认的名字是arraytype（有关详细信息，您将需要咨询此功能的源代码）。


参数：pkgname
Character. Package name. If NULL the name is derived from arraytype.
字符。包的名称。如果为NULL的名字来源于从arraytype。


参数：comparewithcdf
Logical. If TRUE, run a consistency check against a CDF package of the same name (what used to be Laurent's "extraparanoia".)
逻辑。如果是TRUE，对一个相同名称的民防包运行的一致性检查（什么是洛朗“extraparanoia”。）


Details

详情----------Details----------

This function serves as an interface between the (1) representation of array probe information data in the packages that are generated by makeProbePackage and (2) the vendor- and possibly version-specific way the data are represented in datafile.
此功能提供<X阵探针信息数据（1）表示在makeProbePackage（2）供应商和版本特定的方式表示数据在生成的包之间的接口>

datafile is a tabulator-separated file with one row per probe, and column names 'Probe X', 'Probe Y', 'Probe Sequence', and 'Probe.Set.Name'. See the vignette for an example.
datafile是与每一个探测行制表符分隔的文件，以及列名'Probe X'，'Probe Y'，'Probe Sequence'，'Probe.Set.Name'。看到一个例子的小插曲。


值----------Value----------

A list with three components
三个组成部分的列表


参数：dataEnv
an environment which contains the data frame with the probe sequences and the other probe data.
环境，其中包含了与探针序列和其他探测数据的数据框。


参数：symVal
a named list of symbol value substitutions which can be used to customize the man pages. See createPackage.
命名的符号价值，可用于定制的手册页换人名单。看到createPackage。


参数：pkgname
a character with the package name; will be the same as the function parameter pkgname if it was specified; otherwise, the name is constructed from the parameter arraytype.
一个包的名称字符;将作为函数的参数pkgname如果它被指定相同的，否则，这个名字是从参数arraytype兴建。


参见----------See Also----------

makeProbePackage
makeProbePackage


举例----------Examples----------


  ## Please refer to the vignette[＃请参阅的小插曲]

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