ads.ternaries(simba)
ads.ternaries()所属R语言包：simba
Artificial data-set for studying the mathematical behavior of asymmetric similarity coefficients
人工的数据设定为研究的数学行为的非对称的相似性系数
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Artificial data-set as utilized in Koleff et al. 2003, and Jurasinski 2007 to study the mathematical behavior of asymmetrical similarity indices. The corresponding values of all indices computable with sim are contained. See example!
人工数据设置为利用在Koleff等。 2003年，2007年和Jurasinski学习数学行为的非对称相似性指数。相应的所有可计算的sim的指数值都包含。见的例子！
用法----------Usage----------
data(ads.ternaries)
格式----------Format----------
ads.ternariesdata.frame with the three matching components of asymmetric binary similarity measures (a, b, c) with all possible combinations of these components derived from a virtual data-set with 100 variables (species). These are the first three columns. The preceding columns contain the values of the similarity coefficients computable with sim according to the three matching components. This information can be used to study the mathematical behavior of the indices. See example
ads.ternariesdata.frame的三个匹配元件的非对称的二进制相似措施(a, b, c)衍生自这些组件与所有可能的组合的一个虚拟数据，设定具有100个变量（种）。这是第一个三列。前面的列中包含的值的相似系数计算的sim根据三个匹配的组件。此信息可用于研究中指数的数学行为。查看范例
源----------Source----------
Jurasinski, G. (2007) Spatio-Temporal Patterns of Biodiversity and their Drivers - Method Development and a Case Study from Northeastern Morocco. PhD-Thesis, Department of Biogeography, University of Bayreuth
Jurasinski，G.（2007）时空变化的生物多样性及其驱动程序 - 方法开发和东北摩洛哥的情况研究。博士论文，拜罗伊特大学生物GEO学系，
Koleff, P., Gaston, K. J. & Lennon, J. J. (2003) Measuring beta diversity for presence-absence data. Journal of Animal Ecology 72: 367-382.
Koleff，P.，加斯东，KJ＆列侬，JJ（2003）测量β多样性的存在不存在的数据。 [动物学报72：367-382。
实例----------Examples----------
data(ads.ternaries)
library(plotrix)
##take any index you want to study, see the help for sim() for available [＃采取任何你想学习的索引，提供的帮助（SIM）]
##asymmetric indices or the names of the data.frame:[＃不对称指数或名称的数据框：]
names(ads.ternaries)
##make a tmp from the index you want to study (we perform a transformation [＃一个tmp的索引你想学习（我们执行转换]
##to obtain values between 0 and 1). if you want another index, [＃，得到的值在0和1之间）。如果你想另外一个索引，]
##just change the name in the next line:[＃只是改变了名称中的下一行：]
tmp <- ads.ternaries$mountford
tmp <- (tmp-min(tmp))/max(tmp)
triax.plot(ads.ternaries[,c(2,3,1)], main="mountford",
col.symbols=grey(seq(0.1,1,0.1))[floor((tmp*100)/5)+1], pch=16)
##don't wonder: mountford is strange, just try another one:[＃不怀疑：芒福德奇怪的是，只是尝试另一种：]
##this time with rainbow-colors[＃这一次彩虹的颜色]
tmp <- ads.ternaries$soerensen
tmp <- (tmp-min(tmp))/max(tmp)
triax.plot(ads.ternaries[,c(2,3,1)], main="s酶rensen",
col.symbols=rainbow(10)[floor((tmp*100)/10)+1], pch=16)
##and an interesting shape: routledge in greyscale...[＃和灰度一个有趣的形状：劳特利奇...]
tmp <- ads.ternaries$routledge
tmp <- (tmp-min(tmp))/max(tmp)
triax.plot(ads.ternaries[,c(2,3,1)], main="routledge",
col.symbols=grey(seq(0.1,1,0.1))[floor((tmp*100)/5)+1], pch=16)
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发表于 2012-9-30 02:28:07
