R语言 annotate包 PWAmat()函数中文帮助文档(中英文对照)

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PWAmat(annotate)
PWAmat()所属R语言包：annotate

                                        A function to compute the probe to KEGG pathway incidence matrix.
                                         一个函数来计算探针KEGG通路的关联矩阵。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

For a given chip we compute the mapping from probes to KEGG pathways.
对于一个给定的芯片，我们计算从探针映射到KEGG通路。


用法----------Usage----------


PWAmat(data)



参数----------Arguments----------

参数：data
The name of the chip for which the incidence matrix should be computed.
的发病矩阵应计算芯片的名称。


Details

详情----------Details----------

Not much to say, just find which probes are in which pathways and return the incidence matrix, with pathways as rows and probes as columns.
没有什么好说的，只要找到探针哪些途径和返回发病矩阵，行和列作为探针的途径。

It would be nice to be able to specify a set of probes to use, so that  one does not do perform the calculations using all probes if they are not of interest.
这将是很好，是可以指定一组探针使用，这样一个不执行所有探针使用的计算，如果他们不感兴趣。


值----------Value----------

A matrix containing zero or one, depending on whether the probe (row) is in a pathway (column).
包含零个或一个矩阵，取决于探针（行）是否在通路（列）。


作者（S）----------Author(s)----------


R. Gentleman



参见----------See Also----------

KEGG2heatmap, GOmnplot
KEGG2heatmap，GOmnplot


举例----------Examples----------


  library("hgu95av2.db")
  Am1 <- PWAmat("hgu95av2")

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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