SubRidgeogram(SigWinR)
SubRidgeogram()所属R语言包:SigWinR
Extract a ridgeogram for a sub-sequences from a larger Ridgeogram
一个子序列,从更大范围Ridgeogram提取一个ridgeogram
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Create a ridgeogram for a subsequence from the ridgeogram of a sequence. The result is different from that of direct application of Ridgeogram to the subsequence.
创建一个从ridgeogram在序列的一个子序列ridgeogram为。结果是不同的从直接应用Ridgeogram到的子序列。
用法----------Usage----------
SubRidgeogram(rg,start,stop)
参数----------Arguments----------
参数:rg
ridgeogram
ridgeogram
参数:start
start of the sub sequence
启动子序列
参数:stop
end of the sub sequence
的子序列结束
Details
详细信息----------Details----------
The interpretation of start and stop depends on the existence of position information in the input ridgeogram. If available then start and stop are interprented as postions; otherwise the start and stop are used as indexes in the sequence array.
启动和停止的解释取决于位置信息的存在在输入ridgeogram。如果可用,则启动和停止,interprented作为志愿服务岗位,否则启动和停止作为序列中的数组中的索引。
值----------Value----------
A ridgeogram representing the subsequence.
的序列一个ridgeogram。
(作者)----------Author(s)----------
w.c.deleeuw@uva.nl
参考文献----------References----------
enriched windows of genomic features related to DNA sequences Marcia A Inda, Marinus F van Batenburg, Marco Roos, Adam SZ Belloum, Dmitry Vasunin, Adianto Wibisono, Antoine HC van Kampen, and Timo M Breit
参见----------See Also----------
Ridgeogram,PosRidgeogram,RidgeogramPlot
Ridgeogram,PosRidgeogram,RidgeogramPlot
实例----------Examples----------
lseq <- c(rnorm(200),rnorm(100,-1),rnorm(50),rnorm(50,4.0),rnorm(100))
RidgeogramPlot(SubRidgeogram(Ridgeogram(lseq),325,375),0.5,
"Example subridgeogram",high.col="green",low.col="red")
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