R语言 annotate包 GOmnplot()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

GOmnplot(annotate)
GOmnplot()所属R语言包：annotate

                                        A function to plot by group means against each other.
                                         函数绘制组是指对对方。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

For a two sample comparison, as determined by group, and a specified KEGG pathway or GO category, per group means are computed and plotted against each other.
为两个样本比较，确定group，并指定KEGG通路或类别，每个组的方式计算和暗算对方。


用法----------Usage----------


GOmnplot(x, eset, data = "hgu133plus2", group, ...)
KEGGmnplot(x, eset, data = "hgu133plus2", group, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
The name of the KEGG pathway or GO category.
KEGG通路的名称或类别。


参数：eset
An ExpressionSet containing the data.
ExpressionSet包含的数据。


参数：data
The name of the chip that was used to provide the data.
芯片被用来提供数据的名称。


参数：group
The variable indicating group membership, should have two different values.
变量组成员，都应该有两种不同的价值观。


参数：...
Extra parameters to pass to the call to plot.
额外的参数传递给调用plot。


Details

详情----------Details----------

All probes in eset that map to the given category are determined. Then per group, per probe means are computed and plotted against each other. Extra parameters can be passed to the plot function via the dots argument.
eset映射到给定类别确定所有探针。然后每个组，每个探针的手段对对方的计算和绘制。额外的参数，可以通过dots参数传递给绘图功能。


值----------Value----------

The matrix of per group means, for each probe.
每个组的矩阵表示，每个探针。


作者（S）----------Author(s)----------


R. Gentleman



参见----------See Also----------

KEGG2heatmap
KEGG2heatmap


举例----------Examples----------


  library("hgu95av2.db")
  data(sample.ExpressionSet)
  KEGGmnplot("04810", sample.ExpressionSet, sample.ExpressionSet$sex,
             data = "hgu95av2")

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