R语言 shapes包 testmeanshapes()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

testmeanshapes(shapes)
testmeanshapes()所属R语言包：shapes

                                        Tests for mean shape difference, including permutation and bootstrap tests
                                         平均形状的差异，包括置换和引导测试的测试

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Carries out tests to examine differences in mean shape between two independent populations, for $m=2$ or $m=3$ dimensional data.  Tests are carried out using tangent co-ordinates.
进行测试，以检验两个独立的群体的平均形状之间的差异，$ M = 2 $ $ M = 3维数据。进行了试验，使用切线统筹。

H : Hotelling $T^2$ statistic (see Dryden and Mardia, 1998, equ.(7.4))
H：的Hotelling T ^ 2 $统计（见，1998年德莱顿和Mardia的设备（7.4））

G : Goodall's F statistic (see Dryden and Mardia, 1998, equ.(7.9))
G：Goodall的F统计量（见，1998年德莱顿和Mardia的，当量。（7.9））

J : James $T^2$ statistic (see Amaral et al., 2007)
J：詹姆斯·T ^ 2统计（见阿马拉尔等人，2007年）

p-values are given based on resampling (either a bootstrap test or a permutation test)  as well as the usual table based p-values. Bootstrap tests involve sampling with replacement under H0  (as in Amaral et al., 2007).
p-值是给定的基于重采样（无论是自举测试或一个排列的测试），以及通常的表为基础的p-值。引导涉及抽样测试，更换下H0（阿马拉尔等，2007）。

Note when the sample sizes are low (compared to the number of landmarks) some minor regularization  is carried out. In particular if Sw is a singular within group covariance matrix, it is replaced by  Sw + 0.000001 (Identity matrix) and a "*" is printed in the output.
请注意，当样本数低（地标建筑的数量）进行了一些小的正规化。特别是如果SW是一个单一的组内协方差矩阵，取代SW + 0.000001（单位矩阵）和印有“*”的输出。


用法----------Usage----------


testmeanshapes(A, B, resamples = 1000, replace = TRUE, scale= TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：A
The random sample for group 1: k x m x n1 array of data, where k is the number of landmarks and n1 is the sample size. (Alternatively a k x n1 complex matrix for 2D)
第1组：kxmx的N1阵列的数据，其中k是数的地标和N1随机抽样的样本量。 （另外一个k x为N1复杂的2D矩阵）


参数：B
The random sample for group 2: k x m x n2 array of data, where k is the number of landmarks and n2 is the sample size. (Alternatively a k x n2 complex matrix for 2D)
组2：kxmx n2的阵列的数据，其中，k是地标和n2的数目的随机样本是样本大小。 （另外一个K X N2复杂的2D矩阵）


参数：resamples
Integer. The number of resampling iterations. If resamples = 0 then no resampling procedures are carried out, and the tabular p-values are given only.
整数。重采样的迭代的数量。如果重新采样= 0，则没有再采样程序进行，而只给出了片状的p-值。


参数：replace
Logical. If replace = TRUE then bootstrap resampling is carried out with replacement *within* each group. If replace = FALSE then permutation  resampling is carried out (sampling without replacement in *pooled* samples).
逻辑。如果更换= TRUE然后引导重采样进行与更换* *各组内。如果更换= FALSE，则置换重采样（采样*合并*样品无需更换）。


参数：scale
Logical. Whether or not to carry out Procrustes with scaling in the procedure.
逻辑。无论开展的Procrustes扩大过程中的。


值----------Value----------

A list with components
组件列表


参数：H
The Hotelling statistic (F statistic)
的Hotelling统计量（F统计量）


参数：H.pvalue
p-value for the Hotelling test based on resampling
p值的霍特林测试的基础上重新取样


参数：H.table.pvalue
p-value for the Hotelling test based on the null F distribution, assuming normality and equal covariance matrices
p值的霍特林测试空的F分布的基础上，假设正常和平等的协方差矩阵


参数：J
The James $T^2$ statistic
詹姆斯$ T ^ 2统计


参数：J.pvalue
p-value for the James $T^2$ test based on resampling
p值的詹姆斯$ T ^ 2的基础上重新取样测试


参数：J.table.pvalue
p-value for the James $T^2$ test based on the null F distribution, assuming normality but unequal covariance matrices   
p值的詹姆斯$ T ^ 2检验空的F分布的基础上，假设正常，但不平等的协方差矩阵


参数：G
The Goodall $F$ statistic
古道尔$ F $统计


参数：G.pvalue
p-value for the Goodall test based on resampling
p值的珍古德测试的基础上重新取样


参数：G.table.pvalue
p-value for the Goodall test based on the null F distribution, assuming normality and equal isotropic covariance matrices)
p值古道尔测试空的F分布的基础上，假设正态性和各向同性的协方差矩阵相等）


（作者）----------Author(s)----------


Ian Dryden



参考文献----------References----------

$k$-sample problems in directional statistics and shape analysis.  Journal of the American Statistical Association.   102, 695-707.
Wiley, Chichester. Chapter 7.
of shape (with discussion). Journal of the Royal Statistical Society, Series B, 53: 285-339.

参见----------See Also----------

resampletest
resampletest


实例----------Examples----------



#2D example : female and male Gorillas[2D例如：雌性和雄性大猩猩]

data(gorf.dat)
data(gorm.dat)

#just select 3 landmarks and the first 10 observations in each group[选择3的地标和10个观察各组第一]
A<-gorf.dat
B<-gorm.dat
testmeanshapes(A,B,resamples=100)


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。