R语言 annotate包 getOntology()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

getOntology(annotate)
getOntology()所属R语言包：annotate

                                        Get GO terms for a specified ontology
                                         得到去指定的本体

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Find the subset of GO terms for the specified ontology, for each element  of the supplied list of associations. The input list is typically from one of the chip-specific meta-data files.
查找指定本体的GO术语的子集，为协会提供的名单中的每个元素。输入列表通常是从芯片的特定元数据文件之一。


用法----------Usage----------


getOntology(inlist, ontology=c("MF", "BP", "CC"))



参数----------Arguments----------

参数：inlist
A list of GO associations
好协会名单


参数：ontology
The name of the ontology you want returned.
希望返回的本体的名称。


Details

详情----------Details----------

The input list should be a list of lists, each element of inlist is itself a list containing the information that maps from a specified  ID (usually LocusLink) to GO information. Each element of the inner list  is a list with elements GOID, Ontology and Evidence.
输入列表中应该有一个列表，inlist本身就是一个列表，其中包含的信息，从指定的ID（通常LocusLink）映射到信息的每个元素。内部列表的每个元素是一个元素的列表GOID，Ontology和Evidence。


值----------Value----------

A list of the same length as the input list. Each element of this list will contain a vector of GOIDs for those terms that match the requested ontology.
相同长度作为输入列表列表。这个名单中的每个元素将包含这些条款，符合要求的本体了GOID的向量。


作者（S）----------Author(s)----------


R. Gentleman



参见----------See Also----------

getEvidence, dropECode
getEvidence，dropECode


举例----------Examples----------


library("hgu95av2.db")
bb <- hgu95av2GO[["39613_at"]]
getOntology(bb)
sapply(bb, function(x) x$Ontology)

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注：
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