filterGOByOntology(annotate)
filterGOByOntology()所属R语言包:annotate
Filter GO terms by a specified GO ontology
过滤器由指定的GO本体的GO术语
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Given a character vector containing GO identifiers, return a logical vector indicating which GO IDs are in the specified ontology (BP, CC, or MF).
由于含有好标识符的字符向量,返回一个逻辑向量去标识,在指定的本体(BP,CC或MF)。
用法----------Usage----------
filterGOByOntology(goids, ontology = c("BP", "CC", "MF"))
参数----------Arguments----------
参数:goids
a character vector of GO IDs
一个好标识的特征向量
参数:ontology
One of "BP", "CC", or "MF"
其中:“BP”,“抄送”或“MF”
值----------Value----------
A logical vector with length equal to goids. A TRUE indicates that the corresponding GO ID in goids is a member of the ontology specified by ontology.
一个逻辑向量的长度等于goids的。一个TRUEgoids相应的GO ID是ontology指定的本体成员。
作者(S)----------Author(s)----------
Seth Falcon
举例----------Examples----------
haveGO <- suppressWarnings(require("GO.db"))
if (haveGO) {
ids <- c("GO:0001838", "GO:0001839")
stopifnot(all(filterGOByOntology(ids, "BP")))
stopifnot(!any(filterGOByOntology(ids, "MF")))
} else cat("Sorry, this example requires the GO package\n")
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