R语言 seqRFLP包 raw2Fas()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

raw2Fas(seqRFLP)
raw2Fas()所属R语言包：seqRFLP

                                        Read and converting raw DNA files to fasta format.
                                         阅读和FASTA格式将原始DNA的文件。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Given the specified directory, this function could read and convert raw DNA files to fasta format. It is an alternative to read.fasta as the later read only one fasta file. The advantage of using raw2Fas  when dealing with fasta files rather than using file.cat is that this function would convert the fasta files to the fasta in a robost way.
在指定的目录，这个函数可以读取并转换成原始的DNA文件FASTA格式。这是一个替代read.fasta后来只读取一个fasta格式文件。的优势，利用raw2Fas在处理fasta格式的文件，而不是使用file.cat是，这个函数会转换成fasta格式的FASTA在一个robost的方式。


用法----------Usage----------


raw2Fas(dir = NULL, appendix = ".fasta")



参数----------Arguments----------

参数：dir
a character string naming the directory fasta files exist.  
一个字符串命名的目录fasta格式的存在。


参数：appendix
Appendix of raw DNA data files to combine.
附录的原始DNA数据文件结合起来。


Details

详细信息----------Details----------

Only the file possesses the the specied appendix will be read and converted.
只有文件具有的specied附录的读取和转换。


值----------Value----------

Returns the object of class "fasta".
返回的对象类“FASTA”。


（作者）----------Author(s)----------



Jinlong zhang <a href="mailto:jinlongzhang01@gmail.com">jinlongzhang01@gmail.com</a>
Qiong Ding <a href="mailto:dingqiong1@gmail.com">dingqiong1@gmail.com</a>




参考文献----------References----------

None.

参见----------See Also----------

See Also read.fasta, file.cat for importing "fasta" files from local machine.
请参见read.fasta，file.cat输入"fasta"从本地计算机中的文件。


实例----------Examples----------



#########[＃＃＃＃＃＃＃＃]
######[＃＃＃＃＃]
### raw2Fas() example[＃＃raw2Fas（）的例子]
cat(
">No305",
"NTTCGAAAAACACACCCACTACTAAAANTTATCAGTCACT",
file = "dna1.fas", sep = "\n")
cat(
">No304",
"ATTCGAAAAACACACCCACTACTAAAAATTATCAACCACT",
file = "dna2.fas", sep = "\n")
cat(
">No305",
"NTTCGAAAAACACACCCACTACTAAAANTTATCAGTCACT",
file = "dna3.fas", sep = "\n")

raw2Fas(getwd(), appendix = ".fas")

unlink("dna1.fas")
unlink("dna2.fas")
unlink("dna3.fas")


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