R语言 seqinr包 splitseq()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

splitseq(seqinr)
splitseq()所属R语言包：seqinr

                                         split a sequence into sub-sequences
                                         分裂成子序列的序列

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Split a sequence into sub-sequences of 3 (the default size) with no overlap between the sub-sequences.
一个序列分割成子序列3（默认大小）与子序列之间没有重叠。


用法----------Usage----------


splitseq(seq, frame = 0, word = 3)



参数----------Arguments----------

参数：seq
a vector of chars  
字符的向量


参数：frame
an integer (0, 1, 2) giving the starting position to split the sequence  
一个整数（0，1，2）给分裂序列的起始位置


参数：word
an integer giving the size of the sub-sequences  
子序列的大小的一个整数，给出


值----------Value----------

This function returns a vector which contains the sub-sequences.
这个函数返回一个矢量，它包含的子序列。


（作者）----------Author(s)----------


J.R. Lobry



参考文献----------References----------

<br>

参见----------See Also----------

split
split


实例----------Examples----------


cds <- s2c("aacgttgcaggtcgctcgctacgtagctactgttt")
#[]
# To obtain the codon sequence in frame 0:[要获得密码子序列，在第0帧：]
#[]
stopifnot(identical(splitseq(cds),
  c("aac", "gtt", "gca", "ggt", "cgc", "tcg", "cta", "cgt", "agc", "tac", "tgt")))
#[]
# Show the effect of frame and word with a ten char sequence:[一个10字符序列帧和字的显示效果：]
#[]
(tenchar <- s2c("1234567890"))
splitseq(tenchar, frame = 0)
splitseq(tenchar, frame = 1)
splitseq(tenchar, frame = 2)
splitseq(tenchar, frame = 0, word = 2)
splitseq(tenchar, frame = 0, word = 1)

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