R语言 seqinr包 as.alignment()函数中文帮助文档(中英文对照)

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as.alignment(seqinr)
as.alignment()所属R语言包：seqinr

                                        Constructor for class alignment
                                         构造函数类对齐

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Returns an object of (S3) class alignment.
返回一个对象（S3）类调整。


用法----------Usage----------


as.alignment(nb = NULL, nam = NULL, seq = NULL, com = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：nb
integer. The number of sequences in the alignment.
整数。在对准的序列数。


参数：nam
vector of nb character strings. The sequence names.  
矢量nb的字符串。序列名称。


参数：seq
vector of nb character strings. The aligned sequences.
矢量nb的字符串。对齐的序列。


参数：com
vector of nb character strings. The comments about sequences.
矢量nb的字符串。的意见大约序列。


值----------Value----------

An object of class alignment which is a list with the following components:
类的一个对象alignment这是一个列表有以下组件：


参数：nb
the number of aligned sequences  
对准的序列的数目


参数：nam
a vector of strings containing the names of the aligned sequences   
含一个字符串矢量对齐序列的名称


参数：seq
a vector of strings containing the aligned sequences  
含有对齐序列的向量的字符串


参数：com
a vector of strings containing the commentaries for each sequence or NA if there are no comments  
评注，每一个序列或字符串包含一个矢量的NA，“如果没有意见


（作者）----------Author(s)----------


D. Charif, J.R. Lobry



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

read.alignment, as.matrix.alignment, read.fasta,  write.fasta, reverse.align, dist.alignment.
read.alignment，as.matrix.alignment，read.fasta，write.fasta，reverse.align，dist.alignment。


实例----------Examples----------


as.alignment(nb = 2, nam = c("one", "two"),
  seq = c("-ACGT", "GACG-"), com = c("un", "deux"))

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