R语言 seqinr包 acnucopen()函数中文帮助文档(中英文对照)

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acnucopen(seqinr)
acnucopen()所属R语言包：seqinr

                                        open and close a remote access to an ACNUC database
                                         打开和关闭远程访问到ACNUC数据库

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

These are low level functions to start and stop a remote access to an ACNUC database.
这是低层次的功能，启动和停止远程访问到一个ACNUC的数据库。


用法----------Usage----------


acnucopen(db, socket, challenge = NA)
acnucclose(socket)
clientid(id = paste("seqinr_", packageDescription("seqinr")$Version, sep = ""), socket, verbose = FALSE)
quitacnuc(socket)



参数----------Arguments----------

参数：db
the remote ACNUC database name
的远程ACNUC数据库名称


参数：socket
an object of class sockconn connecting to an ACNUC server
类的一个对象sockconn连接到一个ACNUC的服务器


参数：challenge
unimplemented yet
未实现，但


参数：id
client ID definition defaulting to seqinr + package version number
客户端ID的定义，默认为seqinr +软件包的版本号


参数：verbose
logical, if TRUE mode verbose is on
逻辑，如果真实模式的详细


Details

详细信息----------Details----------

these low level functions are usually not used directly by the user.  Use choosebank to open a remote ACNUC database and closebank to close it.
这些低级别的功能通常不是由用户直接使用。使用choosebank打开一个远程ACNUC的数据库和closebank关闭它。


值----------Value----------

For openacnuc a list with the following components: type : the type of database that was opened. totseqs, totspec, totkey : total number of seqs, species, keywords in opened database. ACC\_LENGTH, L\_MNEMO, WIDTH\_KW, WIDTH\_SP, WIDTH\_SMJ, WIDTH\_AUT,  WIDTH\_BIB, lrtxt, SUBINLNG: max lengths of record keys in database.
对于openacnuc的列表以下部分组成：类型：已打开的数据库类型。 totseqs，totspec，totkey总数的seqs，品种，关键字，在打开的数据库。 ACC \ _length，L \ _MNEMO，宽度\ _KW，宽\ _SP，宽\ _SMJ，宽度\ _AUT，宽度\ _BIB，lrtxt，SUBINLNG：最大长度在数据库中的记录键。


（作者）----------Author(s)----------


J.R. Lobry



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

choosebank, closebank
choosebank，closebank


实例----------Examples----------


## Not run: # Need internet connection[＃不运行：＃需要互联网连接]
  mysocket <- socketConnection( host = "pbil.univ-lyon1.fr",
    port = 5558, server = FALSE, blocking = TRUE)
  readLines(mysocket, n = 1) # OK acnuc socket started[OK acnuc插座开始]
  acnucopen("emblTP", socket = mysocket) -> res
  expected <- c("EMBL", "14138095", "236401", "1186228", "8",
    "16", "40", "40", "20", "20", "40", "60", "63")
  stopifnot(all(unlist(res) == expected))
  tryalreadyopen <- try(acnucopen("emblTP", socket = mysocket))
  stopifnot(inherits(tryalreadyopen, "try-error"))
  # Need a fresh socket because acnucopen() close it if error:[需要一个新的套接字，因为acnucopen（）关闭，如果错误：]
  mysocket <- socketConnection( host = "pbil.univ-lyon1.fr",
    port = 5558, server = FALSE, blocking = TRUE)
  tryoff <-  try(acnucopen("off", socket = mysocket))
  stopifnot(inherits(tryoff, "try-error"))

  mysocket <- socketConnection( host = "pbil.univ-lyon1.fr",
    port = 5558, server = FALSE, blocking = TRUE)
  tryinexistent <-  try(acnucopen("tagadatagadatsointsoin", socket = mysocket))
  stopifnot(inherits(tryinexistent, "try-error"))

  mysocket <- socketConnection( host = "pbil.univ-lyon1.fr",
    port = 5558, server = FALSE, blocking = TRUE)
  trycloseunopened <- try(acnucclose(mysocket))
  stopifnot(inherits(trycloseunopened, "try-error"))


## End(Not run)[＃（不执行）]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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