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R语言 seqinr包 AAstat()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-9-30 01:13:31 | 显示全部楼层 |阅读模式
AAstat(seqinr)
AAstat()所属R语言包:seqinr

                                         To Get Some Protein Statistics
                                         为了得到一些蛋白质统计

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Returns simple protein sequence information including the number of residues,  the percentage physico-chemical classes and the theoretical isoelectric point.
返回简单的蛋白质序列信息,包括残留物的数量,百分比的物理 - 化学类和理论等电点。


用法----------Usage----------


AAstat(seq, plot = TRUE)



参数----------Arguments----------

参数:seq
a protein sequence as a vector of upper-case chars  
作为向量的大写字符的蛋白质序列


参数:plot
if TRUE, plots the presence of residues splited by  physico-chemical classes along the sequence.  
如果TRUE,图存在splited沿该序列的物理化学类的残留物。


值----------Value----------

A list with the three following components:
列表以下三个部分组成:


参数:Compo
A factor giving the amino acid counts.
一个因素的氨基酸计数。


参数:Prop
A list giving the percentage of each physico-chemical classes (Tiny, Small, Aliphatic, Aromatic, Non-polar, Polar, Charged, Positive, Negative).
一个列表,给出的百分比,每个物理化学类(微型,小型,脂肪族,芳香族,非极性,极性,充电,正,负)。


参数:Pi
The theoretical isoelectric point
理论等电点


(作者)----------Author(s)----------


D. Charif, J.R. Lobry



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

computePI, SEQINR.UTIL, SeqFastaAA
computePI,SEQINR.UTIL,SeqFastaAA


实例----------Examples----------


  seqAA <- read.fasta(file = system.file("sequences/seqAA.fasta", package = "seqinr"), seqtype = "AA")
  AAstat(seqAA[[1]])

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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