R语言 seqCBS包 ScanStatNewComp()函数中文帮助文档(中英文对照)

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ScanStatNewComp(seqCBS)
ScanStatNewComp()所属R语言包：seqCBS

                                         Main new window scan statistics computation
                                         主要的新窗口扫描统计计算

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This is a wrapper function to call the C routines for the scan statistic new candidate segmentation computing from the IGS
这是一个包装函数来调用的C程序的扫描统计量的新的候选分割计算的IGS


用法----------Usage----------


ScanStatNewComp(combZCumSum, combXCumSum, combZPoint, combXPoint, p, nTotal, grid.cur, max.win, statistic)



参数----------Arguments----------

参数：combZCumSum
A cumulative sum of the number of case reads
数的情况下读取的累计总和


参数：combXCumSum
A cumulative sum of the number of reads
的读取次数的累计总和


参数：combZPoint
The number of case reads at the grid points
在网格点的数量的情况下读取


参数：combXPoint
The number of reads at the grid points
格点处的读取次数


参数：p
The proportion of case reads in the current region
的情况下，读取到当前区域中的比例


参数：nTotal
The total number of reads in the current region
当前区域中读出的总数


参数：grid.cur
The current grid to be computed on
目前的计算网格，


参数：max.win
The maximum inter-window to be considered for new scan
间的最大窗口将被视为新的扫描


参数：statistic
The type of statistic. Can be 'binomial','rabinowitz' or 'normal'
统计的类型。可以“二项式”，“拉比诺维茨”或“正常”


Details

详细信息----------Details----------

The computations are done in C for speed. The three types of statistics are by the use of exact binomial likelihood ('binomial'), score statistic ('rabinowitz') or using normal approximation to the binomial ('normal').
在C计算的速度。这三种类型的统计信息，是由使用的确切的二项式似然（二项式），得分统计（拉比诺维茨）或使用正常的近似的二项式（“正常”）。


值----------Value----------

Returns a matrix containing the candidate change points from the new scan
返回基质中含有的候选变化点新的扫描


（作者）----------Author(s)----------



Jeremy J. Shen




参见----------See Also----------

ScanCBS, ScanIterateGrid
ScanCBS，ScanIterateGrid

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