R语言 seqCBS包 relCNComp()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

relCNComp(seqCBS)
relCNComp()所属R语言包：seqCBS

                                         Compute the Relative Copy Number
                                         计算的相对拷贝数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This computes the relative copy number by each of the segment called
这计算的相对拷贝数由每个段称为


用法----------Usage----------


relCNComp(combX, combZ, tauHatInd, p, alpha)



参数----------Arguments----------

参数：combX
The number of reads at each unique read position
的数目在每个唯一的读取位置读取


参数：combZ
The number of case/tumor reads at each unique read position
/肿瘤的情况下读取数据时，读每一个独特的位置


参数：tauHatInd
The index of change points called
该指数的变化点称为


参数：p
The overall proportion of case reads
总体比例的情况下读取


参数：alpha
Significance level for testing whether each segment is a gain (relative CN > 1) or loss (relative CN < 1). The method internally corrects for multiple testing.
用于测试是否每个部分的收益（相对CN> 1）或损失（相对于CN <1）的显着性水平。该方法在内部纠正多个测试。


Details

详细信息----------Details----------

The relative CN is defined as the number of case reads divided by the number of control reads in a window, adjusted for overall proportion of case reads (divided by the overall relative CN).
被定义为相对CN的情况下读出的数目除以数量的控制，读出在一个窗口中，调整整体的比例的情况下读取（除以整体相对CN）。


值----------Value----------

Returns a vector of relative CN for each of the segment between two change points
返回一个向量，为两个变化点之间的各段的相对CN


（作者）----------Author(s)----------



Jeremy J. Shen


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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。