readListInputFile(seqCBS)
readListInputFile()所属R语言包:seqCBS
Read meta file containing list of raw data files
元文件,其中包含的原始数据文件列表
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Reads a meta file that contains the file names and type of the data files. See details for the format.
读取元文件包含的数据文件的文件名和文件类型。查看详细资料的格式。
用法----------Usage----------
readListInputFile(inputFilename, sep = "\t")
参数----------Arguments----------
参数:inputFilename
The name of file, containing relevant information of all input files
文件的名称,包含所有的输入文件的相关信息
参数:sep
Delimiter of the meta input file, default is tab-delimited
元输入文件中的分隔符,默认为制表符分隔
Details
详细信息----------Details----------
The meta input file should be organized in a table format with 2 columns, one of which is 'file' and the other is 'type', indicating the data file names and whether the data is from 'normal' or 'tumor'.
元的输入文件组织,应用2列,其中之一是“文件”,另一种是“类型”,表示该数据文件的名称和该数据是否是从“正常”或“肿瘤”以表格式。
值----------Value----------
<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"><td>normalFiles </td> <td> A character vector containing the names of files with the normal reads</td></tr> <tr valign="top"><td>tumorFiles </td> <td> A character vector containing the names of files with the tumor reads</td></tr> </table>
<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"> <TD> normalFiles </ TD> <TD>向量的文件名与正常读取一个字符</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD> tumorFiles </ TD> <TD>包含的文件名与肿瘤读取一个字符向量</ TD> </ TR> </ TABLE>
(作者)----------Author(s)----------
Jeremy J. Shen
参见----------See Also----------
readInput, readSeq
readInput,readSeq
实例----------Examples----------
# This shows the format of the meta file[这示出的格式的元文件]
data(JSSim_Meta)
print(JSSim_Meta)
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