nhppRateEstimate(seqCBS)
nhppRateEstimate()所属R语言包:seqCBS
Estimate the rate of non-homogeneous PP with data
估计与数据率的非均质的PP
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Given a vector of point events, give a rough estimate of the rate of underlying non-homogeneous Poisson process by window and smoothing
鉴于点事件的向量,得到底层的非齐次泊松过程的速率的一个粗略的估计由窗口和平滑
用法----------Usage----------
nhppRateEstimate(controls, length.out = floor(length(controls)/20), lowessF = 0.1)
参数----------Arguments----------
参数:controls
A vector of point locations (read positions) of a control sample for which the rate is wanted
率控制样品被通缉的矢量点位置(位置)
参数:length.out
The number of windows to be used for the rate estimate vector; default to be number of observations/100
的窗口的数目被使用的速率估测矢量;默认为是数observations/100
参数:lowessF
Smoothing factor for the lowess smoothing of the windowed rates, describes the proportion of windows around a particular window that has influence on its smoothed rate estimate
的LOWESS平滑的平滑因子的窗口税率,描述了窗口的比重围绕一个特定的窗口,有其平滑率估计的影响
Details
详细信息----------Details----------
This is used to give a realistic estimate of the rate nhpp of control samples
这是用来给一个现实的估计的速度NHPP控制样品
值----------Value----------
Returns a vector of length length.out that contains the smoothed rate estimate of each window
返回一个向量,长度为length.out包含的各个窗口的平滑化率的估计
(作者)----------Author(s)----------
Jeremy J. Shen
参见----------See Also----------
nhppSimulate
nhppSimulate
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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