appendCdfEnvAffy(altcdfenvs)
appendCdfEnvAffy()所属R语言包:altcdfenvs
append probe sets to a CdfEnvAffy
追加探针设置到CdfEnvAffy
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
append probe sets to a CdfEnvAffy
追加探针设置到CdfEnvAffy
用法----------Usage----------
appendCdfEnvAffy(acdfenv, id, i, nocopy = TRUE)
参数----------Arguments----------
参数:acdfenv
instance of class CdfEnvAffy
实例类CdfEnvAffy
参数:id
identifier for the probe set to add
探针标识设置添加
参数:i
a matrix of indexes (see details)
matrix索引(见详情)
参数:nocopy
whether to make a copy of the environment or not (see details)
是否要对环境的副本或(见详情)
Details
详情----------Details----------
The matrix i must have one column per probe type. For typical Affymetrix chip types, there are two probe types: "pm" and "mm".
matrixi必须有每一个探针类型的列。对于典型的Affymetrix公司的芯片类型,有两个探针类型:"pm"和"mm"。
nocopy set to TRUE means that the environment is added the probe set 'in-situ' (this can boost execution speed if you add a lot of probe sets).
nocopy设置为TRUE是指环境中添加探针集“在原位”(这可以提高执行速度,如果添加了很多探针集)。
值----------Value----------
An CdfEnvAffy is returned
CdfEnvAffy返回
举例----------Examples----------
data(cdfenvEx)
## pm and mm probe set[#下午毫米探针组]
m <- matrix(1:10, ncol = 2)
colnames(m) <- c("pm", "mm")
appendCdfEnvAffy(cdfenvEx, "blabla", m)
indexProbes(cdfenvEx, c("pm", "mm"), "blabla")
## pm only probe set[#下午只探针组]
m <- matrix(6:9, ncol = 1)
colnames(m) <- c("pm")
appendCdfEnvAffy(cdfenvEx, "blabla2", m)
## note that the unspecified "mm" were set to NA[#注意,未指定的“MM”设置为NA]
indexProbes(cdfenvEx, c("pm", "mm"), "blabla2")
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