R语言 AgiMicroRna包 tgsNormalization()函数中文帮助文档(中英文对照)

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tgsNormalization(AgiMicroRna)
tgsNormalization()所属R语言包：AgiMicroRna

                                         Normalization Between Arrays
                                         标准化阵列之间

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Normalization between arrays of the Total Gene Signal. The function is a wrapper of the 'limma' 'normalizeBetweenArrays' with ('none','quantile','scale') methods
标准化之间的共有基因信号阵列。该函数是一个包装“limma（没有，分量，规模）方法”normalizeBetweenArrays“


用法----------Usage----------


tgsNormalization(ddTGS, NORMmethod = "quantile", makePLOTpre = FALSE, makePLOTpost = FALSE, targets,verbose=FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：ddTGS
uRNAList, containing the output from tgsMicroRna  
uRNAList，包含从tgsMicroRna输出


参数：NORMmethod
character specifying the normalization method, 'none','quantile','scale'. The  default is quantile  
字符指定的规范化方法，无，分量，规模。默认是quantile


参数：makePLOTpre
logical, if TRUE QC plots with the Raw Total Gene Signal are displayed   
逻辑，如果TRUEQC原料共有的基因信号图显示


参数：makePLOTpost
logical, if TRUE QC plots with the Normalized Total Gene Signal are displayed   
逻辑，如果TRUE归共有的基因信号的质量控制图显示


参数：targets
data.frame with the target structure  
数据框与目标结构


参数：verbose
logical, if TRUE prints out output
逻辑，如果TRUE打印出输出


值----------Value----------

A uRNAList object containing the Normalized Total Gene Signal in log 2 scale
一个uRNAList对象，其中包含归log规模的共有基因信号


作者（S）----------Author(s)----------


Pedro Lopez-Romero



参考文献----------References----------

'Bioinformatics and Computational Biology Solutions Using R and Bioconductor'. R. Gentleman, V. Carey, S. Dudoit, R. Irizarry, W. Huber (eds), Springer, New York, pages 397 - 420
Methods 31, 265-273.

举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
data(dd.micro)
data(targets.micro)
ddTGS=tgsMicroRna(dd.micro,half=TRUE,makePLOT=FALSE,verbose=FALSE)

ddNORM=tgsNormalization(ddTGS,'quantile',
                makePLOTpre=FALSE,makePLOTpost=TRUE,targets.micro,verbose=TRUE)
graphics.off()


## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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