readTargets(AgiMicroRna)
readTargets()所属R语言包:AgiMicroRna
read the target file
读取目标文件
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The target file is a txt file created by the user where every input file (array, sample) is attached to a experimental condition
目标文件是由每一个输入文件(阵列,样品)连接到实验条件的用户创建一个txt文件
用法----------Usage----------
readTargets(infile,verbose=FALSE)
参数----------Arguments----------
参数:infile
name of the target file, for instance 'targets.micro.txt'
目标文件的名称,例如“targets.micro.txt”
参数:verbose
logical, if TRUE prints out output
逻辑,如果TRUE打印出输出
Details
详情----------Details----------
In the 'target' file (see Table 1 in vignette) we specify the experimental conditions under which the data have been generated. The target file MUST contain the following mandatory columns: -FileName : Name of the array data file -Treatment : Treatment effect -GErep : Treatment effect in numeric code, from '1' to 'n', being 'n' the number of the levels of the treatment effect
在“目标”的文件(见表1中的小插曲)我们指定的实验条件下,根据该数据已经生成。目标文件必须包含下列强制列:文件名:名称:阵列的数据文件的处理治疗效果GErep:数字代码的治疗效果,从1,N,N的数量水平的治疗效果
Other explanatory variables specifying the experimental conditions might be also included.
可能还包括其他解释变量指定的实验条件。
值----------Value----------
A 'data.frame' containing by the columns specified in the input file targets.txt. This 'targets.txt' file must be created by the user.
在输入文件targets.txt指定列包含一个数据框“。这“targets.txt文件必须由用户创建的。
作者(S)----------Author(s)----------
Pedro Lopez-Romero
参考文献----------References----------
'Bioinformatics and Computational Biology Solutions using R and Bioconductor'. R. Gentleman, V. Carey, S. Dudoit, R. Irizarry, W. Huber (eds), Springer, New York, pages 397–420.
参见----------See Also----------
An example of a target file can be found in targets.micro
一个目标文件的例子可以发现targets.micro
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
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