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R语言 SEERaBomb包 mkSEER()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-9-30 00:09:07 | 显示全部楼层 |阅读模式
mkSEER(SEERaBomb)
mkSEER()所属R语言包:SEERaBomb

                                         Make SEER data binaries
                                         SEER数据的二进制文件

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function converts large SEER ASCII text data files into smaller R binaries.
此功能将大SEER ASCII文本数据文件转换成较小的R二进制文件。


用法----------Usage----------





参数----------Arguments----------

参数:df
A data frame that was the output of pickFields. This determines which fields to transfer.  
这是一个数据框的输出pickFields。这决定了哪些领域转移。


参数:seerHome
The directory that contains the SEER "population" and "incidence" directories.  This should be writable by the user.
该目录包含SEERpopulation和incidence目录。这应该是用户可写的。


参数:dataset
The SEER dataset to use. These are uniquely identified by the starting year, 1973 = SEER 9, 1992 = SEER 13, and 2000 = SEER 18, where in SEER X, X is the number of SEER registries. The options are c("yr2000_2009","yr1973_2009", "yr1992_2009") and the choice determines the subdirectory of "incidence" and "population" to use as well as the name of the subdirectory of seerHome to which the R data files will be written.   
的SEER数据集使用。这些都具有唯一的起始年,1973年=季节能效比SEER 9日,1992 = 13 2000 = 18 SEER,其中在SEER X,X是SEER登记的数量。选项c("yr2000_2009","yr1973_2009","yr1992_2009")和选择确定的子目录中的incidence和population以及使用的名称的子目录seerHomeR数据文件将被写入。


参数:SQL
TRUE if an SQLite database is to be created and populated with tables. The single file "all.db" produced in this case can be significantly larger than the sum of the "*.RData" files also produced.  Use of this option is experimental so the default is FALSE.   
TRUE,如果一个SQLite数据库来创建和填充表。单个文件all.db在这种情况下,可以产生显着大于*.RData也产生的文件的总和。是实验性的,所以使用此选项默认为FALSE。


Details

详细信息----------Details----------

This function uses the R package LaF to access the fixed-width format data files  of SEER. LaF is fast, but it requires knowledge of all the widths of columns wanted, as well as the the widths of unwanted stretches in between. This knowledge is produced   by getFields() and pickFields() combined. It is passed to mkSEER as the argument df.
此功能使用的R套件“LaF访问的SEER固定宽度格式的数据文件。 LaF是速度快,但它需要的所有列的宽度想要的知识,以及不必要的绵延之间的宽度。是由getFields()和pickFields()相结合,这方面的知识。它传递给mkSEER作为参数df。


值----------Value----------

None. This function is called for its side-effects: it produces R binary data files.
无。这种功能被称为其副作用:它产生R二进制数据文件。


注意----------Note----------

This version of SEERaBomb works only with the SEER data release of April 2012. Using the default field choices of pickFields(), computing times range from ~10 seconds for 1992-2009 processing without SQLite database generation, to  ~90 seconds for 1973-2009 processing with SQLite database generation. This work was supported by the National Cancer Institute and Tufts Integrative
此版本的SEERaBomb仅适用于2012年4月发布的SEER数据。 (1992-2009)处理,而不使用默认的字段选择pickFields(),计算时间范围从10秒~90秒SQLite数据库生成,处理与SQLite数据库生成1973至2009年。该工作得到了美国国家癌症研究所和美国塔夫茨中西医结合


(作者)----------Author(s)----------


Tom Radivoyevitch (<a href="mailto:txr24@case.edu">txr24@case.edu</a>)



参见----------See Also----------

SEERaBomb-package,getFields,pickFields
SEERaBomb-package,getFields,pickFields


实例----------Examples----------


## Not run: [#不运行:]
library(SEERaBomb)
(df=getFields())
(df=pickFields(df))
mkSEER(df,dataset="yr1992_2009")  # fastest option[最快的选项]
# the following takes ~4 minutes, but may only need to be done once per year, with each release.[下面以~4分钟,但可能只需要每年要进行一次,与每一个版本。]
mkSEER(df,dataset="yr1992_2009",SQL=TRUE)
mkSEER(df,dataset="yr1973_2009",SQL=TRUE)
mkSEER(df,dataset="yr2000_2009",SQL=TRUE)

## End(Not run)[#(不执行)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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