R语言 secr包 secr.design.MS()函数中文帮助文档(中英文对照)

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secr.design.MS(secr)
secr.design.MS()所属R语言包：secr

                                         Construct Detection Model Design Matrices and Lookups
                                         构建检测模型的设计矩阵和查找

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Internal function used by secr.fit.
内部功能使用secr.fit。


用法----------Usage----------


secr.design.MS(capthist, models, timecov = NULL, sessioncov = NULL,
    groups = NULL, dframe = NULL, naive = FALSE, bygroup = FALSE,
    ...)



参数----------Arguments----------

参数：capthist
capthist object  
capthist对象


参数：models
list of formulae for parameters of detection  
检测的参数的公式列表


参数：timecov
optional dataframe of values of time (occasion-specific) covariate(s).  
可选的数据框的时间值（特定场合）协（S）。


参数：sessioncov
optional dataframe of values of session-specific covariate(s).  
可选的数据框的特定会话的协变量（S）的值。


参数：groups
optional vector of one or more variables with which to form groups. Each element should be the name of a factor variable in the covariates attribute of capthist.  
与一个或多个变量，以形成一组可选的矢量。的每个元素都应该是一个因素变量在covariates属性capthist的名称。


参数：dframe
optional data frame of design data for detection parameters  
可选的数据框的检测参数设计数据


参数：naive
logical if TRUE then modelled detection probability is for a naive animal (not caught previously); if FALSE then detection probability is contingent on individual's history of detection  
TRUE，则模拟检测概率逻辑，如果是一个天真的动物（以前没有抓到）;如果为假则检测概率是或然的检测个人的历史


参数：bygroup
logical if TRUE then the individual dimension of the parameter matrix is automatically collapsed to one row per group; if FALSE then the full dimensionality is retained (one row per individual)  
逻辑，如果是TRUE，那么各个维度的参数矩阵自动倍数一个每行集团;如果为FALSE，则全维被保留（一排，每个人）


参数：...
other arguments passed to the R function model.matrix  
其他参数传递给R的功能model.matrix


Details

详细信息----------Details----------

This is an internal secr function that you are unlikely ever to use. ... may be used to pass contrasts.arg to model.matrix.
这是一个内部secr，你是不可能使用的功能。 ...可用于，通过contrasts.arg到model.matrix。

Each real parameter is notionally different for each unique combination of session, individual, occasion and detector, i.e., for R sessions, n individuals, S occasions and K detectors there are potentially R x n x S x K different values. Actual models always predict a much reduced set of distinct values, and the number of rows in the design matrix is reduced correspondingly; a parameter index array allows these to retrieved for any combination of session, individual, occasion and detector.
每一个真正的参数是名义上不同的会议，个别场合和检测器，即每一个独特的组合，R会议，n个人，S场合和K探测器可能R x n x S x K不同的值。该型号的实际预测大大减少设置不同的值，并设计矩阵中的行数相应减少;参数索引数组允许这些检索的会议，个别场合和检测器的任意组合。


值----------Value----------

A list with the components
的组件列表


参数：designMatrices
list of reduced design matrices, one for each real detection parameter  
降低设计矩阵列表，一个用于每个真实的检测参数


参数：parameterTable
index to row of the reduced design matrix for each real detection parameter; dim(parameterTable) = c(uniquepar, np), where uniquepar is the number of unique combinations of paramater values (uniquepar < RnSK) and np is the number of parameters in the detection model.  
指数降低了设计矩阵的行为每个实际检测参数; DIM（参数）= C（uniquepar，NP），，在那里uniquepar的数量独特的组合paramater值（uniquepar <RnSK）和NP是检测模型中的参数的数目。


参数：PIA
Parameter Index Array - index to row of parameterTable for a given session, animal, occasion and detector; dim(PIA) = c(R,n,S,K)  
参数索引数组 - 索引行的参数为一个给定的会话，动物，场合和检测器;暗淡（PIA）= C（R，N，S，K）


参见----------See Also----------

D.designdata
D.designdata


实例----------Examples----------


secr.design.MS (captdata, models = list(g0 = ~b))$designMatrices
secr.design.MS (captdata, models = list(g0 = ~b))$parameterTable

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