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R语言 AgiMicroRna包 dd.micro()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 11:37:45 | 显示全部楼层 |阅读模式
dd.micro(AgiMicroRna)
dd.micro()所属R语言包:AgiMicroRna

                                         data example (uRNAList)
                                         数据的例子(uRNAList)

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Data, extracted from scanned images using Agilent Feature Extraction Software, are stored in a uRNAList object.
从扫描图像使用安捷伦特征提取软件提取,存储的数据,在uRNAList对象。


用法----------Usage----------


data(dd.micro)



Details

详情----------Details----------

A data example is provided. The data example includes 3 experimental conditions with two replicates.
提供一个数据的例子。数据的例子包括有两个重复的实验条件。

For these data, chips were scanned using the Agilent G2567AA Microarray Scanner System (Agilent Technologies) Image analysis and data collection were carried out using the Agilent Feature Extraction 9.1.3.1. (AFE).
对于这些数据,芯片采用安捷伦G2567AA芯片扫描系统(安捷伦科技)图像分析和数据收集,使用安捷伦的特征提取9.1.3.1进行了扫描。 (AFE)的。

Data, colected with the Agilent Feature Extraction Software, are stored in a uRNAList object with the following components:
colected安捷伦特征提取软件,数据,存储在以下组件uRNAList对象:




uRNAList\$TGS  matrix, 'gTotalGeneSignal'
uRNAList \ $ TGS的矩阵,gTotalGeneSignal“




uRNAList\$TPS  matrix, 'gTotalProbeSignal'
uRNAList \ $ TPS的矩阵,gTotalProbeSignal“




uRNAList\$meanS matrix, 'gMeanSignal'
uRNAList \ $表示矩阵,gMeanSignal“




uRNAList\$procS matrix, 'gProcessedSignal'
uRNAList \ $特效矩阵,gProcessedSignal“




uRNAList\$targets  data.frame, 'FileName'
uRNAList \ $目标数据框,文件名




uRNAList\$genes\$ProbeName  vector of characters, 'AGilent Probe Name'
uRNAList \ $基因的字符\ $ ProbeName向量,“安捷伦探针名称




uRNAList\$genes\$GeneName  vector of characters, 'microRNA Name'
uRNAList \ $基因的字符\ $ GeneName向量,microRNA的名称“




uRNAList\$genes\$ControlType  vector of integers, '0'= Feature, '1'= Positive control, '-1'= Negative control
uRNAList \ $基因\ $的ControlType向量整数,0“=功能,1=阳性对照,-1=阴性对照




uRNAList\$other\$gIsGeneDetected  matrix, FLAG to classify signal if 'IsGeneDetected=1' or 'not=0'
如果IsGeneDetected uRNAList \ $ \ $ gIsGeneDetected矩阵,标志进行分类信号= 1或= 0“




uRNAList\$other\$gIsSaturated  matrix, FLAG to classify signal if 'IsSaturated = 1' or 'not=0'
uRNAList \ $ \ $ gIsSaturated矩阵,标志分类如果IsSaturated = 1或= 0“的信号




uRNAList\$other\$gIsFeatPopnOL  matrix, FLAG to classify signal if 'IsFeatPopnOL = 0' or 'not=1'
uRNAList \ $ \ $ gIsFeatPopnOL矩阵,标志进行分类的信号,如果“IsFeatPopnOL = 0或不= 1




uRNAList\$other\$gIsFeatNonUnifOL  matrix, FLAG to classify signal if 'gIsFeatNonUnifOL = 0' or 'not=1'
uRNAList \ $ \ $ gIsFeatNonUnifOL矩阵,标志进行分类的信号,如果“gIsFeatNonUnifOL = 0或不= 1




uRNAList\$other\$gBGMedianSignal  matrix, gBGMedianSignal
uRNAList \ $ \ $ gBGMedianSignal矩阵,gBGMedianSignal




uRNAList\$other\$gBGUsed  matrix, gBGUsed
uRNAList \ $ \ $ gBGUsed矩阵,gBGUsed


作者(S)----------Author(s)----------


Pedro Lopez-Romero



参见----------See Also----------

readMicroRnaAFE.Rd
readMicroRnaAFE.Rd

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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