cosinor(season)
cosinor()所属R语言包:season
Cosinor regression model for detecting seasonality
用于检测季节性的余弦回归模型
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Fits a cosinor model as part of a generalized linear model.
适用于一个的余弦模型作为广义线性模型的一部分。
用法----------Usage----------
参数----------Arguments----------
参数:formula
regression formula.
回归公式。
参数:date
a date variable if type=“daily”, or an integer between 1 and 12 if type=“monthly”.
日期变量,如果type =“每天”,或1到12之间的整数如果type =“每月”。
参数:data
data set as a data frame.
作为数据框的数据集。
参数:family
a description of the error distribution and link function to be used in the model. Available link functions: identity, log, logit, cloglog. Note, it must have the parentheses.
在模型中使用的误差分布的描述和链接功能。可用链接的功能:身份,记录,罗吉,cloglog;。注意,它必须有括号。
参数:alpha
significance level, set to 0.05 (default).
显着性水平设置为0.05(默认值)。
参数:cycles
number of seasonal cycles per year.
每年的季节性周期。
参数:rescheck
plot the residual checks (TRUE/FALSE), see seasrescheck.
绘制残留的检查(TRUE / FALSE),请参阅seasrescheck。
参数:type
“daily” for daily data (default), or “monthly” for monthly data.
“每日每日数据(默认)”,或“每月”月度数据。
参数:offsetmonth
include an offset to account for the uneven number of days in the month (TRUE/FALSE). Should be used for monthly counts (with family=poisson()).
包括一个偏移量的不均匀月份的天数(TRUE / FALSE)。应使用的月数(用family=poisson())。
参数:offsetpop
include an offset for the population (optional), this should be a variable in the data frame.
包括一个偏移量的人口(可选),这应该是一个数据框中的变量。
参数:text
add explanatory text to the returned phase value (TRUE) or return a number (FALSE). Passed to the invyrfraction function.
返回的相位值(TRUE)或添加的说明文字(FALSE)返回一个数字。传递给invyrfraction功能。
Details
详细信息----------Details----------
The cosinor model captures a seasonal pattern using a sinusoid. It is therefore suitable for relatively simple seasonal patterns that are symmetric and stationary. The default is to fit an annual seasonal pattern (cycle=1), but other frequencies are possible (e.g., twice per year: cycle=2). The model is fitted using a sine and cosine term that together describe the sinusoid. These parameters are added to a generalized linear model, so the model can be fitted to a range of dependent data (e.g., Normal, Poisson, Binomial). Unlike the nscosinor model, the cosinor
余弦模型捕获的季节性模式,使用正弦曲线。因此,它是适合于相对简单的季节性模式是对称的和固定。默认情况下是适合每年的季节性模式(cycle= 1),但其他频率是可能的(例如,每年两次:cycle= 2)。该模型是使用正弦和余弦项,它们一起描述的正弦曲线拟合。这些参数被添加到一个广义线性模型,该模型可以被安装到了一系列相关的数据(如正常,泊松分布,二项分布)。不同的是nscosinor模型,余弦
值----------Value----------
Returns an object of class “Cosinor” with the following parts:
返回一个对象类“余弦”包括以下部分:
参数:call
the original call to the cosinor function.
原始呼叫的余弦函数。
参数:glm
an object of class glm (see glm).
类的一个对象glm(见glm)。
参数:fitted
fitted values for intercept and cosinor only (ignoring other independent variables).
拦截和余弦拟合值(忽略其他自变量)。
参数:fitted.plus
standard fitted values, including all other independent variables.
标准,包括所有其他独立变量的拟合值。
参数:residuals
residuals.
残留物。
参数:date
date variable (in Date format when type="daily").
日期变量(日期格式时=每天)。
(作者)----------Author(s)----------
Adrian Barnett <a href="mailto:a.barnett<at>qut.edu.au">a.barnett<at>qut.edu.au</a>
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
summary.Cosinor, plot.Cosinor
summary.Cosinor,plot.Cosinor
实例----------Examples----------
## cardiovascular disease data (offset based on number of days in... [#心血管疾病的数据(偏移量的基础上数天英寸..]
## ...the month scaled to an average month length)[#...缩放月平均每月长)]
data(CVD)
res = cosinor(cvd~1, date=month, data=CVD, type='monthly',
family=poisson(), offsetmonth=TRUE)
summary(res)
# stillbirth data[死胎数据]
data(stillbirth)
res = cosinor(stillborn~1, date=dob, data=stillbirth,
family=binomial(link='cloglog'))
summary(res)
plot(res)
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