nopt_random(SE.IGE)
nopt_random()所属R语言包:SE.IGE
function for optimum family sizes and standard errors of genetic parameters
功能遗传参数,以获得最佳的家庭规模和标准错误
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
function calculating optimum family sizes and corresponding standard errors of genetic parameters for direct, indirect total genetic variance, and for T2. For groups composed at
函数计算最佳的家庭规模和相应的标准错误,直接的,间接的遗传变异的遗传参数,并为T2。对于群体组成的
用法----------Usage----------
nopt_random(T,vpd,vps,h2d,h2s,rgds,reds,nw,r)
参数----------Arguments----------
参数:T
total number of individuals, #families*family size, numeric
个体总数,#家庭*家庭大小,数字
参数:vpd
phenotypic (i.e. full) variance of direct effect, numeric
表型方差(即全)的直接影响,数字
参数:vps
phenotypic variance of indirect ("associative) effect, numeric
间接(联想)的影响,数字的表型变异
参数:h2d
heritability of direct effect, Var(DGE) = h2d*vpd, numeric
遗传的直接影响,VAR(DGE)= H2D架次,数字
参数:h2s
heritability of indirect effect, Var(IGE) = h2s*vps, numeric
遗传间接影响,VAR(IGE)= H2S车辆定位系统,数字
参数:rgds
genetic correlation direct-indirect effect
遗传相关性的直接的,间接的影响
参数:reds
residual correlation direct-indirect effect
残余相关的直接,间接影响
参数:nw
group size, i.e. total number of individuals in a group, numeric
组的大小,即个体总数的一组数字
参数:r
additive genetic relatedness between family members, e.g. r=0.25 for half sibs, numeric
家庭成员之间的相关性,例如加性遗传R = 0.25,半同胞,数字
值----------Value----------
returns a matrix, 4 rows x 3 columns row=1: direct genetic effects row=2: indirect genetic effects row=3: total genetic effects row=4: ratio of total genetic variance over phenotypic variance, T2 column=1: optimum number of families for this row column=2: optimum family size for this row column=3: standard error for this row
返回一个矩阵,4行×3列排= 1:直接遗传效应行= 2:的间接遗传效应行= 3:总的遗传效应= 4行:比对表型变异的遗传变异,T2 = 1列:最佳数量此行的列= 2:最佳家庭此行的列的大小= 3:此行的标准错误的家庭
(作者)----------Author(s)----------
P.Bijma; piter.bijma@wur.nl
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
vvarb
vvarb
实例----------Examples----------
T <- 2000
vpd <- 100
vps <- 10
h2d <- 0.3
h2s <- 0.3
rgds <- 0.1
reds <- 0.1
nw <- 4
r <- 0.5
optima <- nopt_random(T,vpd,vps,h2d,h2s,rgds,reds,nw,r)
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