R语言 Agi4x44PreProcess包 RLE()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

RLE(Agi4x44PreProcess)
RLE()所属R语言包：Agi4x44PreProcess

                                         Relative Log Expression
                                         相对log表达

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

RLE: Relative Log Expression
游程：相对log表达


用法----------Usage----------


RLE(object, maintitle, colorfill)



参数----------Arguments----------

参数：object
An expression matrix, in log2 scale   
表达式矩阵，以log2规模


参数：maintitle
title of the plot   
图称号


参数：colorfill
color of the plot   
颜色的图


Details

详情----------Details----------

Each Boxplot corresponds to a sample and displays the Relative Log Expression computed for every spot in the array as the difference between the spot intensity and the median intensity for the same feature accros all the arrays. Since  majority of the spots are expected not to be differentially expressed, the plot shoud show boxplots centered around zero and all of them having the aproximately the same dispersion.  An array showing greater dispersion than the other, or  being not centered at zero could have quality problems.
每一个盒形图对应一个样本，并显示相关log表达对数组中的每个点计算，当场强度和中位数的强度相同的功能之间的差异accros所有阵列。由于大部分景点，预计不被差异表达，图电视剧续集失误为零，所有的aproximately相同色散左右集中展示盒状图。显示比其他更大的分散，不集中在零数组可能有质量问题。


作者（S）----------Author(s)----------


Pedro Lopez-Romero



参考文献----------References----------

Cope L., Irizarry R. A., Speed T. P. Quality Assesement of Affymetrix GeneChip Data. In Bioinformatics and Computational Biology Solutions Using R and Bioconductor. (eds.)  Gentleman R.,  Carey V. J., Huber W., Irizarry R. A., Dudoit S. (2005). Springer.

举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
                data(dd)
                maintitle="RLE example "
                colorfill="orange"
                RLE(log2(dd$G),maintitle,colorfill)

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。