R语言 Agi4x44PreProcess包 read.targets()函数中文帮助文档(中英文对照)

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read.targets(Agi4x44PreProcess)
read.targets()所属R语言包：Agi4x44PreProcess

                                         read the target file
                                         读取目标文件

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The target file is a txt file where every input file (array, sample) is attached to a experimental condition
目标文件是一个txt文件，其中每一个输入文件（阵列，样品）连接到实验条件


用法----------Usage----------


        read.targets(infile)



参数----------Arguments----------

参数：infile
name of the target file, for instance 'targets.txt'  
目标文件的名称，例如“targets.txt”


Details

详情----------Details----------

Intention of data preprocessing using Agi4x44PreProces  is to carry out a subsequent statistical analysis searching for genes that are differentially expressed between different  experimental conditions. First, in the 'target file' we specify the  experimental conditions under which the data have been generated.  From this primary statistical analysis, one can be perform other analysis such as Functional Enrichment analysis, etc ... The target file MUST contain the following columns: -FileName        : Name of the array file, xxx.txt -Treatment        : Treatment of the file xxx.txt  -GErep                : Treatment of the file xxx.txt in numeric code, from 'treatment-1' to 'treatment-N'   Other OPTIONAL columns can be -Subject        : If treatment are paired by 'Subject': -Array                : If we want to take into account that some samples have been hibridyzed on the same Agi4x44 platform
数据使用Agi4x44PreProces预处理的目的是进行后续的统计分析，寻找不同的实验条件下差异表达的基因。首先，在“目标文件”，我们指定的实验条件下，根据该数据已经生成。从这个小学的统计分析，可以执行如其他分析功能富集分析等...目标文件必须包含以下几列：文件名：数组文件的名称，xxx.txt治疗：治疗的文件xxx.txt GErep：数字代码的文件xxx.txt的治疗，从治疗1 “可以治疗N”其他可选列主题：如果治疗被配对的“主题”：阵列：如果我们要考虑到一些样品已hibridyzed相同Agi4x44平台


值----------Value----------

A 'data.frame' containing by columns the columns specified in  targets.txt
一个数据框“列包含在targets.txt指定的列


作者（S）----------Author(s)----------


Pedro Lopez-Romero



参见----------See Also----------

read.table
read.table


举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
        targets=read.targets(infile="targets.txt")

## End(Not run)[＃结束（不运行）]
        data(targets)

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