PCAplot(Agi4x44PreProcess)
PCAplot()所属R语言包:Agi4x44PreProcess
PCA plot
PCA的图
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
It is a wrapper for the 'plotPCA' of the 'affycoretools' package
这是一个,“plotPCA”“affycoretools”包包装
用法----------Usage----------
PCAplot(eset, targets)
参数----------Arguments----------
参数:eset
An Expression Set object
表达式设置对象
参数:targets
data.frame with the target structure
数据框与目标结构
作者(S)----------Author(s)----------
Pedro Lopez-Romero
举例----------Examples----------
## Not run: [#无法运行:]
data(dd)
data(targets)
selSNR=which(dd$genes$ControlType==0)
dd.aux=dd[selSNR,]
index=which(duplicated(dd.aux$genes$ProbeName)==FALSE)
dd.aux=dd.aux[index,]
eset.test=build.eset(dd.aux,targets,makePLOT=FALSE,
annotation.package="hgug4112a.db")
PCAplot(eset.test,targets)
## End(Not run)[#结束(不运行)]
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